瓠瓜KNOX基因家族全基因组鉴定及组织表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐晓燕

作者： 徐晓燕;黄小忠;刘万仙;张曼

作者机构：

关键词： 瓠瓜;KNOX;生物信息学;组织表达

期刊名称： 西北农林科技大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-9387

年卷期： 2024 年 003 期

页码： 113-122

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】探明瓠瓜KNOX基因家族特征，在瓠瓜全基因组水平上对KNOX基因家族成员进行鉴定和分析，研究其组织表达模式。【方法】利用生物信息学方法，对瓠瓜KNOX家族基因成员进行鉴定、编码蛋白理化性质分析及家族成员结构域和保守基序分析，利用MEGA 5.05软件构建系统进化树，采用实时荧光定量PCR技术，分析KNOX基因在瓠瓜不同组织（根、茎、叶、花、果实）中的表达情况。【结果】鉴定到12个瓠瓜KNOX家族基因，这些基因分布在6条染色体上，且均定位于细胞核。大多数瓠瓜KNOX家族蛋白含有同源异型盒蛋白特有的4种结构域KNOX1、KNOX2、ELK和Homeobox＿KN。系统进化分析将瓠瓜KNOX基因分为KNOX ClassⅠ和KNOX ClassⅡ2大类群，2个类群又可进一步分为5个分支，其中ClassⅠ-C为瓠瓜特有的进化分支。KNOX基因启动子区有多个激素响应元件和植物生长相关元件。组织表达分析发现，瓠瓜KNOX基因具有不同的表达模式，KNOX ClassⅠ类基因表达具有组织特异性，在根、茎和果实中表达量较高，在其余组织中表达量较低或不表达，其中Lsi04G014450在根和茎中表达量最高，Lsi11G006380在果实中表达量最高；KNOX ClassⅡ类基因在所有组织中均有较高表达。【结论】瓠瓜KNOX基因家族有12个成员，分布于6条染色体上，在进化关系上可分为5组，具有瓠瓜特有的进化分支，在不同组织中的表达具有特异性。

分类号： S642.9

  • 相关文献

[1]暗纹东方鲀sox9基因的克隆和组织表达分析. 高莹莹,刘新富,胡鹏,刘滨,郭正龙. 2019

[2]牦牛SMPX基因CDS区克隆及组织表达分析. 郭梁,王吉坤,王会,柴志欣,信金伟,姬秋梅,钟金城. 2019

[3]绵羊BTG2基因CDs区克隆、生物信息学分析及组织mRNA表达研究. 高一,刘理想,肖成,金海国,马惠海,薛佳佳,魏天,曹阳. 2021

[4]暗纹东方鲀芳香化酶基因的结构及表达分析. 高莹莹,刘新富,胡鹏,黄滨,刘滨. 2020

[5]暗纹东方鲀抗苗勒氏管激素Ⅱ型受体基因的克隆、生物信息学及表达分析. 高莹莹,胡鹏,刘新富,黄滨,刘滨. 2019

[6]延边黄牛ASB12基因的序列分析及组织表达分析. 田万年,张亚丽,郑秀红,李香子,夏广军. 2016

[7]猪雄性增强抗原1基因MEA1编码区克隆、表达及生物信息学分析. 霍海龙,张霞,范俐,赵筱,唐宏涛,高林青,王世雄,杨云,浦仕飞,刘丽仙. 2018

[8]番茄C2H2型锌指蛋白的鉴定及生物信息学分析. 胡军华,王大伟,杨明磊,王新,朱海,朱佩,刘贯山. 2018

[9]美仁牦牛MYL9基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究. 马荣,喇永福,包鹏甲,郭宪,路建卫,扎老,赵雪,梁春年,成述儒. 2024

[10]绵羊卷曲受体1基因克隆、表达谱与多态性分析. 张双双,贾琪,王丹,王卓,柳俭强,张立春,戢爽. 2023

[11]槟榔AcAAP3基因cDNA克隆及其组织表达特性分析. 李佳,曹先梅,谢赛,刘立云. 2019

[12]清远麻鸡miR-142-3p分析及其关键靶基因的筛选. 朱师良,余春林,邱莫寒,张增荣,熊霞,胡陈明,杨礼,彭涵,陈家磊,宋小燕,夏波,杨朝武. 2024

[13]水培瓠瓜生长发育特性研究. 李国景,寿伟林,严见方. 1997

[14]不同瓠瓜品种耐低温能力初探. 邵美红,李国景,戴丹丽. 2001

[15]无公害瓠瓜高产栽培技术. 孙淑琴,刘水芳,杨秀荣. 2009

[16]瓠瓜枯萎病抗性导入西瓜的遗传研究与利用. 刘建雄,肖兰异,吴德喜,罗赫荣. 2000

[17]利用瓠瓜DNA导入西瓜材料选育西瓜抗病品种. 肖兰异,吴德喜,罗赫荣. 1999

[18]外源DNA导入西瓜对后代性状变异的影响. 吴德喜,刘建雄,王双伍. 1999

[19]外源DNA导入创造抗枯萎病西瓜种质资源. 吴德喜,刘建雄,郑素秋,肖兰异. 1999

[20]瓠瓜新品种‘华瓠杂2号’和‘华瓠杂3号’. 李俊丽,汪自松,向长萍. 2007

作者其他论文 更多>>

微信小程序