菊苣OSC基因家族分析及环阿屯醇合酶的鉴定
文献类型: 中文期刊
第一作者: 徐艳茹
作者: 徐艳茹;王晨晨;冯清香;朱哈修;徐朝阳;刘雪;李大勇;唐金富;周军;张彬
作者机构:
关键词: 菊苣;2,3-氧化鲨烯环化酶;生物信息学分析;环阿屯醇合酶
期刊名称: 中国现代中药
ISSN: 1673-4890
年卷期: 2025 年 27 卷 010 期
页码: 1870-1880
收录情况: CSCD
摘要: 目的:对菊苣 2,3-氧化鲨烯环化酶(OSC)基因家族进行鉴定及生物信息学分析,并对菊苣OSC基因家族中的环阿屯醇合酶进行克隆和功能验证.方法:基于菊苣全基因组数据,利用同源比对及保守结构域筛选策略,鉴定出菊苣OSC基因家族成员并进行生物信息学分析,结合系统进化分析与关键功能位点预测,筛选出菊苣环阿屯醇合酶,通过聚合酶链式反应克隆菊苣环阿屯醇合酶,通过气相色谱-质谱法(GC-MS)检测烟草瞬时表达的蛋白质产物,验证菊苣环阿屯醇合酶的功能.结果:鉴定出菊苣中含有 12 个OSC基因家族成员,分布于 6 条染色体,编码蛋白含 696~799 个氨基酸,并且均含有PLN03012 superfamily保守结构域,所有成员都具有多种激素、非生物胁迫和生长发育响应元件,系统进化分析将菊苣OSC基因家族分为 2 个亚家族,鉴定出菊苣的环阿屯醇合酶,命名为CiOSC3,验证其具有环阿屯醇合酶活性.结论:鉴定并系统分析了菊苣OSC基因家族基因,鉴定到 1 个有活性的环阿屯醇合酶CiOSC3.
分类号: R282
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