基于高通量分子标记基因型到表现型预测模型的比较研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 阮文婷

作者： 阮文婷;李慧慧;李仲来;王建康

作者机构：

关键词： 表型预测;大变量小样本问题;回归模型;模型选择;计算机模拟

期刊名称： 第六届全国动植物数量遗传学学术研讨会论文摘要集

ISSN：

年卷期： 2014 年

页码： 1

收录情况： CSCD

摘要： 预测是育种中十分重要的课题。最小二乘线性回归、逐步回归、岭回归、主成分回归以及LASSO回归等是目前比较常用的从基因型到表型的预测方法。当用有限的表型观测数据(n)来估计大量分子标记(p)的效应时,即大变量小样本问题,标记效应无最小二乘解,我们使用广义逆加线性回归来代替最小二乘回归。本文利用连锁图谱构建与QTL作图集成软件QTLIciMapping模拟了群体大小分别为200、1000、5000的重组自交系群体,再对每个群体使用上述方法来建立预测模型。标记效应估计及表型预测值与表型真值的相关系数作为评价预测方法的标准。而标记的效应估计使用标记的

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