北京黑猪FUBP3和USP43基因多态性与眼肌面积性状的关联分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 侯任达
作者: 侯任达;张润;牛乃琪;杨曼;黄晓宇;李慧慧;张龙超
作者机构:
关键词: 北京黑猪;FUBP3;USP43;眼肌面积
期刊名称: 畜牧兽医学报
ISSN: 0366-6964
年卷期: 2022 年 012 期
页码: 4197-4206
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 旨在研究上游远端元件结合蛋白3(far upstream element binding protein 3,FUBP3)及泛素特异性蛋白酶43(ubiquitin specific protease 43,USP43)基因多态性与北京黑猪眼肌面积性状的关系,从而在分子水平指导北京黑猪的育种工作。本研究选取408头北京黑猪收集眼肌面积性状数据并采集肉样提取DNA,根据FUBP3和USP43基因序列设计43对引物进行PCR扩增及测序,运用DNAstar软件分析测序结果,对FUBP3和USP43基因不同基因型与北京黑猪眼肌面积性状进行关联分析并运用荧光定量PCR对两基因进行基因表达差异分析。在FUBP3基因启动子区共有8个突变,其中rs701769847G>A与5~6肋眼肌面积和最后肋眼肌面积均关联显著(P<0.05),rs332131528C>G仅与5~6肋眼肌面积关联显著(P<0.05),rs325550799T>C、rs339464012T>C和rs326069041T>C只与最后肋眼肌面积关联显著(P<0.05);基因表达差异分析表明,rs701769847G>A位点GG型个体的FUBP3基因mRNA水平显著低于AA型个体(P<0.05)。USP43基因启动子区的rs335310752C>T和剪切区的rs323463345G>A均只与最后肋眼肌面积关联显著(P<0.05)。基因表达差异分析表明,rs323463345G>A中GG型个体和AA型个体的USP43基因mRNA水平差异不显著。上述两基因中共有两个位点与5~6肋眼肌面积性状关联显著(P<0.05),6个位点与最后肋眼肌面积性状关联显著(P<0.05),可以作为北京黑猪眼肌面积性状变异的候选基因功能位点,也可以作为潜在的眼肌面积性状分子标记。
分类号: S828.2
- 相关文献
[1]野猪与北京黑猪杂交试验. 何鑫淼,王文涛,吴赛辉,彭福刚,汪博,刘娣. 2011
[2]干酪乳杆菌对北京黑猪育肥阶段肠道消化物菌群组成及乳酸、短链脂肪酸和长链脂肪酸含量的影响. 王四新,季海峰,王红卫,刘辉,石国华,张董燕,王晶,张伟,王雅民. 2020
[3]杜仲粉对松辽黑猪与北京黑猪杂交后代黑猪免疫功能的影响. 王浩,赵少伟,张爽,柴方红,张树敏,王大林,贾立军. 2020
[4]松辽黑猪与北京黑猪杂交后代MyoD1基因的SNP位点分析. 王浩,赵少伟,谢素珠,张树敏,王大林,贾立军. 2020
[5]北京黑猪MYH3和MYH13基因多态性与肉质性状的关联分析. 杨曼,刘海,张润,胡紫平,牛乃琪,王立贤,张龙超. 2022
[6]北京黑猪FSHβ亚基基因的多态性与繁殖性状的关联分析. 罗仍卓么,王立贤,孙世铎. 2007
[7]北京黑猪AQP9和RPS10基因多态性及其与背膘厚的关联分析. 祝雪丽,张龙超,王立贤,蒲蕾,刘欣. 2024
[8]利用超声波图像活体预测北京黑猪肌内脂肪含量. 马小军,程笃学,王立刚,刘欣,宋欣,梁晶,张龙超,颜华,王立贤,陈来华,谢蜀杨. 2012
[9]北京黑猪HoxB簇基因多态性与脊椎数及胴体性状的关联分析. 牛乃琪,苏艳芳,杨曼,侯欣华,王立刚,张龙超. 2023
[10]北京黑猪LPL和NUDT3基因多态性及其与肉质性状的关联分析. 苏艳芳,牛乃琪,宗文成,刘先策,刘海,石国华,井西涛,张龙超. 2024
[11]棉籽饼;猪的良好蛋白质饲料. 高振川,张玉发,金月英,姜云侠,刘金旭. 1982
[12]VRTN和NR6A1基因的因果变异与北京黑猪脊椎数性状的关联分析. 刘倩,岳静伟,牛乃琪,王立贤,张龙超. 2021
[13]北京黑猪RBP4基因与繁殖性状的关联分析. 罗仍卓么,王立贤,孙世铎. 2008
[14]北京黑猪DKK3和CCR1基因多态性检测及其与背膘厚的关联分析. 田威龙,兰干球,张龙超,王立贤,梁晶,刘欣. 2022
[15]论我国地方猪种资源的利用. 王立贤,程笃学,赵克斌,苏振环. 2006
[16]北京黑猪GREB1L和MIB1基因多态性与肋骨数及胴体性状的关联分析. 牛乃琪,赵润泽,宗文成,刘先策,刘海,石国华,井西涛,张龙超. 2024
[17]北京黑猪FABP3和SCD基因多态性与肉品质性状关联分析. 苏艳芳,杨曼,牛乃琪,侯欣华,张龙超. 2023
[18]肉羊眼肌面积4种测定方法的比较. 丁兰兰,刘策,郭娉婷,卢晓楠,徐晨晨. 2016
[19]超声波测定技术在肉牛育种及宰前评定中的应用. 张杨,闫向民,周振勇,张金山,李红波,李娜,袁理星. 2014
[20]家畜背膘厚与眼肌面积的B超测量技术. 周振勇,张杨,李红波,张金山,闫向民,李娜,袁理星,杜玮. 2014
作者其他论文 更多>>
-
北京黑猪AQP9和RPS10基因多态性及其与背膘厚的关联分析
作者:祝雪丽;张龙超;王立贤;蒲蕾;刘欣
关键词:北京黑猪;AQP9;RPS10;背膘厚度;关联分析
-
北京黑猪LPL和NUDT3基因多态性及其与肉质性状的关联分析
作者:苏艳芳;牛乃琪;宗文成;刘先策;刘海;石国华;井西涛;张龙超
关键词:北京黑猪;NUDT3基因;LPL基因;肉品质;关联分析
-
北京黑猪GREB1L和MIB1基因多态性与肋骨数及胴体性状的关联分析
作者:牛乃琪;赵润泽;宗文成;刘先策;刘海;石国华;井西涛;张龙超
关键词:北京黑猪;GREB1L;MIB1;肋骨数;胴体性状
-
北京黑猪HoxB簇基因多态性与脊椎数及胴体性状的关联分析
作者:牛乃琪;苏艳芳;杨曼;侯欣华;王立刚;张龙超
关键词:北京黑猪;HoxB9;HoxB13;脊椎数;胴体性状
-
大白猪仔猪感染流行性腹泻病毒后空肠转录组学变化研究
作者:李慧慧;张美美;元娜;张龙超;王立贤;石丽君
关键词:大白猪仔猪;猪流行性腹泻病毒(PEDV);转录组;功能富集
-
北京黑猪FABP3和SCD基因多态性与肉品质性状关联分析
作者:苏艳芳;杨曼;牛乃琪;侯欣华;张龙超
关键词:北京黑猪;FABP3;SCD;肉品质;关联分析
-
基于基因组SNP和ROH的剑白香猪群体遗传结构解析
作者:胡紫平;王立刚;宗文成;侯任达;苏艳芳;牛乃琪;王立贤;王源;张龙超
关键词:剑白香猪;群体结构;ROH;SNP;遗传多样性