水貂IGF-1R基因SNPs筛查及其与生长性状的关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宋姗姗

作者： 宋姗姗;王雷;宋兴超;邢秀梅;杨福合

作者机构：

关键词： 银蓝水貂;美国短毛黑水貂;IGF-1R基因;遗传标记;生长性状

期刊名称： 吉林农业大学学报

ISSN： 1000-5684

年卷期： 2016 年 38 卷 03 期

页码： 350-356

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为分析IGF-1R基因部分SNPs与银蓝水貂与美国短毛黑水貂2个群体生长性状的关联性。以同龄同场的银蓝水貂和美国短毛黑水貂为研究对象,采用PCR产物直接测序法筛查IGF-1R基因CDS序列的多态位点,利用SPSS(19.0)软件GLM统计模型分析基因SNPs不同基因型与水貂生长性状的相关性。在线软件对IGF-1R基因进行生物信息学分析。结果表明:在IGF-1R基因外显子2和外显子8分别检测到G207A同义突变和G1782A同义突变,根据测序峰图对2位点进行基因分型。群体遗传学分析显示,G207A位点在银蓝水貂群体中属于低度多态,G1782A位点在银蓝水貂群体中属于中度多态,G207A和G1782A 2个位点在美国短毛黑水貂中均为中度多态;χ~2检验表明,银蓝水貂和美国短毛黑水貂群体在2个突变位点处于HardyWeinberg平衡状态(P>0.05);关联分析表明,G1782A位点与美国短毛黑水貂的体重显著相关(P<0.05),突变纯合子AA基因型个体的体重值显著高于GG基因型个体和GA基因型个体。因此G1782A位点适合于短毛黑水貂体重的分子标记选择。

分类号： S865.22

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