菜豆ANK基因家族鉴定及ANK25的表达模式分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张婷

作者： 张婷;张双喜;裴丽丽;于太飞;陈明;李连城;周永斌;马有志;徐强

作者机构：

关键词： ANK重复序列;生物信息学;亚细胞定位;表达模式;菜豆

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2014 年 15 卷 06 期

页码： 1334-1341

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 锚蛋白重复序列模体是生物体内最普遍的蛋白质序列模体之一,在多种细胞活动中主要介导蛋白质-蛋白质的相互作用。本研究利用菜豆基因组数据库,通过生物信息学手段对菜豆ANK家族成员及分子生物学特性进行了鉴定。结果显示,菜豆基因组中含有30个ANK家族基因,分布于9条染色体上,其中第5条染色体上含有的ANK基因最多,包含13个基因。蛋白结构域分析发现,ANK25除了含有ANK结构域外还含有RING结构域。亚细胞定位结果显示,ANK25主要分布在细胞膜上。表达模式分析发现,ANK25对干旱、盐和ABA胁迫有响应。本研究为进一步研究菜豆ANK的分类及功能提供了有利的依据。

分类号： S643.1

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