病毒灭活疫苗诱导云斑尖塘鳢脾脏转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周阳

作者： 周阳;李本旺;林强;付小哲;李敏;梁红茹;刘礼辉;卢伟华;李宁求

作者机构：

关键词： 云斑尖塘鳢;转录组;传染性脾肾坏死病毒;鳜弹状病毒;免疫应答

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2019 年 10 期

页码： 4404-4412

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为阐明云斑尖塘鳢对病毒灭活疫苗的免疫应答机制,本研究采用RNA-sequencing技术结合生物信息学方法分析了传染性脾肾坏死病毒、鳜弹状病毒二联灭活疫苗接种云斑尖塘鳢后脾脏转录谱。分别构建疫苗接种后7 d、14 d脾脏cDNA文库并对其进行高通量测序,共获得85 547条Unigenes,其中32 386条Unigenes被注释;共筛选得到13 593个差异表达基因,其中免疫后7 d上调基因1 291个、下调基因2 030个,14 d上调基因3 732个、下调基因6 540个。GO功能注释显示,差异表达基因编码蛋白主要与免疫应答、细胞黏附以及细胞增殖相关;KEGG分析表明差异表达基因集中在细胞-细胞受体互作通路、细胞粘附分子通路和MAPK信号通路等。选取差异表达的IL-1β、IL-12、MHCⅠ、MHCⅡ等4个基因进行qPCR验证,结果与转录谱结果相符。研究结果为阐明云斑尖塘鳢对传染性脾肾坏死病毒、鳜弹状病毒二联灭活疫苗的免疫应答机制提供依据。

分类号： S943

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