两种SNP分型方法的比较及其在柚品种鉴定中的应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨润婷

作者： 杨润婷;吴波;李翀;曾培;曾继吾;钟云;姜波;周碧容;钟广炎

作者机构：

关键词： 柚;单核苷酸多态性;等位基因特异性 PCR;高分辨率熔解曲线分析;基因分型

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2013 年 40 卷 06 期

页码： 1061-1070

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 用两种常用的 SNP 分型方法,等位基因特异性 PCR 法(Allele-specific PCR,AS-PCR)和高分辨率熔解曲线分析(High resolution melting analysis,HRMA),对 16 个柚栽培品种和 8 个柚杂种后代材料进行了 7 个 SNP 位点的分型研究。结果表明这两种方法所得的分型结果相同,都将 24 个样本分成了 22 种基因型。值得一提的是,样本‘八朔’与‘红八朔’,‘红甘夏’与‘川野夏橙’之间在所测位点无差别,表明其应当是同一来源的无性系变异。‘早熟真龙柚’和‘中熟真龙柚’的分型结果表明它们的基因型不同,看来并非是起源同一基因型的不同芽变品种,也不存在亲子关系。可见,AS-PCR 和 HRMA均适用于柚类品种的区分和鉴定。AS-PCR 法是一种准确、低成本的 SNP 分型方法,适合普通实验室使用,惟对 PCR 反应体系要求严格。HRMA 分型法具有准确、快速、简便、分析量大的特点,但需要专门的设备,试剂成本也高。

分类号： S666.3

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