基于SSR标记分析15个凡纳滨对虾家系遗传多样性和遗传结构

文献类型: 中文期刊

第一作者: 陈文淳

作者: 陈文淳;彭凯;黄敏伟;赵吉臣;张志豪;郭慧;刘锦上;刘振兴;鲁慧杰;黄文

作者机构:

关键词: 凡纳滨对虾;分子标记;核心育种群体;遗传多样性;遗传结构

期刊名称: 生物工程学报

ISSN: 1000-3061

年卷期: 2024 年 40 卷 012 期

页码: 4628-4644

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为明确凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)F1 代核心群体的遗传多样性和遗传结构,本研究利用 15 对多态性较高的微卫星引物对 15 个凡纳滨对虾全同胞家系进行简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记和遗传多样性分析.结果显示,在选择的 15 个SSRs位点中,共检测出 112 个等位基因(number of alleles,Na),60.453 个有效等位基因(number of effective alleles,Ne),多态性信息含量(polymorphism information content,PIC)均值为 0.648.15 个F1 代核心选育家系的平均Ne为 1.925-2.626,平均观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)为 0.425-0.783,平均期望杂合度(expected heterozygosity,He)为 0.403-0.572.聚类分析表明,15 个家系主要分为 3 个类群,遗传距离在 0.252-0.574 之间.各家系间遗传分化系数(fixation index,Fst)为 0.112-0.278,表明群体间存在较大的遗传分化.本研究证明 15 个凡纳滨对虾家系的遗传多样性适中,为后续耐受高水平豆粕饲料的凡纳滨对虾家系选育工作提供了遗传学证据.

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