基于SSR标记分析15个凡纳滨对虾家系遗传多样性和遗传结构
文献类型: 中文期刊
第一作者: 陈文淳
作者: 陈文淳;彭凯;黄敏伟;赵吉臣;张志豪;郭慧;刘锦上;刘振兴;鲁慧杰;黄文
作者机构:
关键词: 凡纳滨对虾;分子标记;核心育种群体;遗传多样性;遗传结构
期刊名称: 生物工程学报
ISSN: 1000-3061
年卷期: 2024 年 40 卷 012 期
页码: 4628-4644
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为明确凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)F1 代核心群体的遗传多样性和遗传结构,本研究利用 15 对多态性较高的微卫星引物对 15 个凡纳滨对虾全同胞家系进行简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记和遗传多样性分析.结果显示,在选择的 15 个SSRs位点中,共检测出 112 个等位基因(number of alleles,Na),60.453 个有效等位基因(number of effective alleles,Ne),多态性信息含量(polymorphism information content,PIC)均值为 0.648.15 个F1 代核心选育家系的平均Ne为 1.925-2.626,平均观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)为 0.425-0.783,平均期望杂合度(expected heterozygosity,He)为 0.403-0.572.聚类分析表明,15 个家系主要分为 3 个类群,遗传距离在 0.252-0.574 之间.各家系间遗传分化系数(fixation index,Fst)为 0.112-0.278,表明群体间存在较大的遗传分化.本研究证明 15 个凡纳滨对虾家系的遗传多样性适中,为后续耐受高水平豆粕饲料的凡纳滨对虾家系选育工作提供了遗传学证据.
分类号:
- 相关文献
[1]草鱼遗传结构和遗传多样性的研究概况. 曹婷婷,白俊杰,王解香,于凌云. 2012
[2]研究稻瘟病菌群体遗传多态性的分子标记方法. 穆慧敏,姜华,王艳丽,孙国昌. 2013
[3]微卫星标记对德国镜鲤选育群体的遗传分析. 李超,鲁翠云,曹顶臣,李崇文,孙效文. 2012
[4]大麦SSR标记遗传多样性及群体遗传结构分析. 王晋,王世红,赖勇,孟亚雄,李葆春,马小乐,尚勋武,王化俊. 2014
[5]四川野生斑茅居群遗传结构的SRAP分析. 张瑜,鄢家俊,白史且,彭燕,梁绪振,张建波,张劲,胡超. 2015
[6]仿刺参微卫星标记的筛选及群体遗传结构分析. 潘传燕,臧云鹏,廖梅杰,王印庚,荣小军,张正,李彬,陈贵平. 2012
[7]利用微卫星PCR分析普安乌骨鸡的遗传结构. 唐继高,朱丽莉,李洪曙,王清颖,韩雁雁. 2015
[8]利用线粒体序列分析黑龙江和松花江流域乌苏里拟鲿种群遗传结构. 吴静,张研,霍堂斌,孙效文. 2013
[9]增殖放流对日本囊对虾群体遗传多样性的影响评估. 魏鸿擎,张凤英,蒋科技,姜亚洲,孟永永,宋炜,马春艳,程家骅,马凌波. 2016
[10]长蛸Octopus variabilis自然群体生化遗传学研究. 高强,郑小东,孔令锋,王昭萍,王如才. 2009
[11]陕西省异色瓢虫种群遗传结构及其多样性. 张小飞,徐玲玲,刘津,白明皓,王振营. 2018
[12]河流型水牛尼里-拉菲和摩拉水牛群体遗传结构分析. 徐文文,孙甜甜,覃广胜,贾银海,王国利,刘瑞鑫,杨秀荣,蒋和生. 2019
[13]瓦氏雅罗鱼达里湖群体和乌苏里江群体的遗传多样性和遗传结构分析. 池炳杰,常玉梅,闫学春,曹顶臣,高玉奎,柳玉海,李勇,梁利群. 2010
[14]北京油鸡群体世代间遗传结构分析. 杨宇泽,张剑,路永强,张权. 2020
[15]基于线粒体控制区序列的花斑蛇鲻遗传多态性分析. 李敏,孔啸兰,许友伟,陈作志. 2020
[16]基于SSR标记的中亚生态区核桃(Juglans regia L.)遗传多样性与种群结构分析. 马凯,赵钰,张恒,韩立群,赵国庆,王继勋. 2021
[17]3个尖塘鳢引进群体繁育后代的遗传多样性分析. 林明辉,朱华平,苏换换,樊佳佳,池金泉,马冬梅. 2021
[18]基于微卫星标记的不同种质资源罗氏沼虾遗传多样性研究. 许珊华,章嘉淇,卢婷,符圆,唐潇,唐琼英,夏正龙,蔡缪荧,高权新,李景芬,杨国梁. 2021
[19]贵州栽培稻的遗传结构及其遗传多样性. 张冬玲,张洪亮,魏兴华,齐永文,王美兴,孙俊立,丁立,汤圣祥,裘宗恩,曹永生,王象坤,李自超. 2006
[20]基于COI序列的长江中上游鲢6个地理群体遗传多样性分析. 沙航,罗相忠,李忠,邹桂伟,梁宏伟. 2018
作者其他论文 更多>>
-
糯稻三系不育系黔糯1A的选育与应用
作者:王珍珍;张宏伟;郝留根;易崇粉;杨春苗;郭慧;杨占烈;向关伦;黄宗洪;甘雨
关键词:糯稻;三系不育系;黔糯1A;选育
-
大蓟水提物抗大口黑鲈虹彩病毒活性研究
作者:马艳平;郝乐;冯国清;王刚;刘振兴
关键词:大蓟提取物;大口黑鲈虹彩病毒;EC50;吞噬;炎症
-
饲料添加γ-氨基丁酸对黄颡鱼幼鱼生长、消化酶活性、lpl和tor基因表达的影响
作者:侯冬强;李敏;赵红霞;李培佳;黄文;曹俊明
关键词:黄颡鱼;γ-氨基丁酸;生长性能;消化;营养代谢基因
-
天然色素鲜度指示膜在食品包装领域的研究进展
作者:刘琳;郑佳楠;张友胜;张业辉;焦文娟;黄文
关键词:新鲜度指示膜;pH显色;天然色素;制备技术
-
饲料中添加缩合单宁、水解单宁和单宁酸对海鲈的饲喂效果研究
作者:孙文豪;董芮绮;邱建强;田仁红;陈冰;赵红霞;黄文;鲁慧杰;胡俊茹;朱喜锋;朱晓闻;曹俊明;彭凯
关键词:缩合单宁;水解单宁;单宁酸;海鲈;饲喂效果
-
高产稳产杂交稻新组合荃香优118的选育及栽培技术
作者:王珍珍;陈琳;张宏伟;严志;杨占烈;甘雨;向关伦;郝留根;郭慧
关键词:荃香优118;选育;特征特性;栽培技术;制种技术
-
发酵黑水虻对斑点叉尾鮰生长、肝脏生化指标、消化吸收和免疫力的影响
作者:郑雨顺;陈桂琼;黄文庆;胡俊茹;彭凯;黄燕华;邹记兴;王国霞
关键词:发酵黑水虻;斑点叉尾?;生长性能;消化酶;生化指标;免疫