中国地方猪品种的遗传多样性与聚类分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 张冬杰

作者: 张冬杰;刘娣;何鑫淼;吴赛辉;王文涛;张旭;汪亮;杨国伟

作者机构:

关键词: 地方猪;线粒体;遗传多样性;分子进化

期刊名称: 畜牧与兽医

ISSN: 0529-5130

年卷期: 2015 年 47 卷 10 期

页码: 1-4

收录情况: 北大核心

摘要: 我国拥有丰富的地方猪资源,也是世界上家猪驯化较早的中心之一。但近40年,地方猪品种受到国外引进猪种的强烈冲击,在数量和规模上均显著降低,遗传资源受到威胁。本研究利用线粒体基因组序列,对我国21个地方猪品种共计86个个体的遗传多样性进行了分析,并构建了43个地方猪品种的分子进化树。结果表明:中国地方猪线粒体D-Loop区存在序列长度多态性。86个序列共检测到32种单倍型,平均单倍型多样性(Hd)为0.966±0.006,平均核苷酸多样性(Pi)为0.00592±0.00023,遗传多样性贫乏。32种单倍型可明显的聚为2大类,但是单倍型的聚类与地理分布没有显著相关性。分子进化树显示中国地方猪与国外猪种处于2个明显不同的分支上;由于受到人类迁徙活动以及不同猪种间基因交流的影响,猪种的聚类关系与地理分布同样不存在显著相关,很难利用线粒体基因组序列对中国地方猪品种进行准确分类。

分类号: S828.8

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