果子蔓凤梨Actin基因的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘建新

作者： 刘建新;葛亚英;田丹青;张智;丁华侨;沈福泉;王炜勇

作者机构：

关键词： 果子蔓凤梨;Actin;克隆

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2011 年 09 卷 01 期

页码： 48-52

收录情况： CSCD

摘要： 持家基因Actin常被用作定量、半定量PCR试验的内参,以确定目标基因的相对表达量。基于前期从全长cDNA文库中获得Actin基因的EST单克隆,进行Primer Walking测序,获得一个Actin基因的全长cDNA序列,序列长1625bp,ORF为1131bp,可编码377个蛋白氨基酸,命名为Goactin1(GenBank登录号:HQ184438)。蛋白质理论分子质量为41.7kD,等电点pI为5.31,包含一个Actin superfamily保守区,二级结构主要由随机卷曲、Alpha螺旋、延伸链和Beta转角组成。此外以2BTF A链为基础建立起了Goactin1蛋白的三级结构图。系统进化树分析表明Goactin1蛋白与马铃薯、棉花、烟草、短柄草、拟南芥等的Actin蛋白聚为一类,它们的亲缘关系最近。

分类号： S682.39

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