甘薯黑斑病菌Cel61A基因克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 罗勤川

作者： 罗勤川;孙厚俊;唐伟;谢逸萍;杨冬静;马居奎;陈晶伟;高方园;张成玲

作者机构：

关键词： 甘薯长喙壳菌;多糖单加氧酶;生物信息学;克隆;基因表达

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2023 年 39 卷 027 期

页码： 103-109

收录情况： CSCD

摘要： 为明确甘薯长喙壳菌致病相关基因多糖单加氧酶基因(CfCel61A)在病菌侵染甘薯中的表达模式及编码蛋白的理化特性.以11株来自不同地区的菌株为材料,克隆并利用生物信息学软件明确CfCel61A蛋白理化性质,用qRT-PCR分析基因表达.结果表明,CfCel61A编码区均为1155 bp,一致率99.5%~100%,编码384个氨基酸,一致率为98.4%~100%;分子量为34.49kDa,等电点为5.59,亲水系数为-0.195,是稳定的亲水蛋白;N端有一个信号肽,亚细胞定位在核内,无跨膜结构;含58个磷酸化和2个糖基化位点,蛋白二级结构无规则卷曲占比最高,为69.01%.CfCel61A在病菌侵染中表达量显著上调,但不同侵染阶段上调幅度不同,侵染'南京92'和'徐薯37'后分别在12h和6h达到最高.综上,CfCel61A在C.fimbriata侵染甘薯中可能发挥重要作用,可为病害药剂开发提供新靶标.

分类号： S435.311

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