出芽短梗霉菌株PA-2全基因组测序及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 高汉峰

作者： 高汉峰;刘晓芳;程亮;朱海霞;杨琼英;张纲;刘玉玲;郭青云

作者机构：

关键词： 出芽短梗霉菌;全基因组测序;水解酶活性;次级代谢产物;生物防治

期刊名称： 微生物学通报

ISSN： 0253-2654

年卷期： 2021 年 009 期

页码： 3002-3012

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【背景】出芽短梗霉菌株PA-2是一株分离自青海省海东市平安区患病杨树叶片上的真菌,前期研究表明该菌株具有除草和抑菌能力,说明其在生物农药方面具有潜在的应用前景。【目的】了解菌株PA-2的基因组序列信息,挖掘其生防相关功能基因簇,为进一步研究解析该菌株生防机理及生防功能改造提供遗传背景信息。【方法】利用IlluminaHiSeq高通量测序平台对生防菌株PA-2进行全基因组测序,用生物信息学的方法对测序数据进行基因组组装、基因预测及功能注释、碳水化合物活性酶预测、次级代谢产物合成基因簇预测,利用刚果红染色等方法对水解酶活性进行衡量。【结果】菌株PA-2基因组序列全长28 932 793 bp,平均GC含量为50%,共编码10 839个基因,预测到该菌株具有4个已知的次级代谢产物合成基因簇,编码Melanin、Burnettramic Acid A、ACR-Toxin I、Abscisic Acid,该菌株能水解纤维素和果胶。【结论】有助于在基因组层面上解析菌株PA-2生防机制的内在原因,为深入了解出芽短梗霉菌次级代谢物合成途径提供参考,对菌株PA-2的下一步相关研究具有重要意义。

分类号： S476.1

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