苎麻WRKY转录因子的序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 付莉莉

作者： 付莉莉;刘头明;朱四元;汤清明;唐守伟

作者机构：

关键词： 苎麻;WRKY转录因子;序列聚类分析;进化树分析

期刊名称： 中国麻业科学

ISSN： 1671-3532

年卷期： 2013 年 003 期

页码： 113-117

摘要： 本研究通过分析苎麻转录组中的基因注释,首次筛选出8个苎麻WRKY转录因子基因序列.结合拟南芥、水稻、大豆和小麦等作物的10个已报道具有抗旱功能的WRKY转录因子序列进行聚类分析,发现这10个具有抗旱功能的WRKY基因和苎麻的8个WRKY基因的蛋白质编码序列高度保守.利用MEGA软件进一步构建这18个WRKY基因的蛋白质序列进化树,结果发现18个WRKY转录因子可以分为4组,其中Unigene5705与CL3777.Contig1和大豆的Gm-WRKY13同属一组,即WRKY-1类;而Unigene5211 CL5210.Contig1,Unigene14199和拟南芥的AtWRKY2同属WRKY-2类;两个苎麻WRKY基因(Unigene22787和Unigene29108)则和六个已报道的抗旱WRKY基因(AtWRKY57,OsWRKY08,OsWRKY11,OsWRKY72,GmWRKY21和GmWRKY54)同属WRKY-3类;CL34.Contig1,TcWRKY53和ABO3/AtWRKY63同属WRKY-4组.由于所有10个拟南芥、水稻、大豆和小麦WRKY基因具有抗旱功能,因此我们推测苎麻的这8个WRKY转录因子很可能也具有抗旱调控功能.

分类号： S563.1

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