数量性状基因的完备区间作图方法

文献类型: 中文期刊

第一作者: 王建康

作者: 王建康

作者机构:

关键词: 数量性状;QTL作图;完备区间作图;加显性效应;上位型互作

期刊名称: 作物学报

ISSN: 0496-3490

年卷期: 2009 年 35 卷 02 期

页码: 239-245

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 结合分子标记和表型数据的QTL作图已成为数量性状遗传分析的常规方法。复合区间作图是近10多年来广泛应用的一种QTL定位方法,但它在算法上有一些缺陷,致使QTL效应可能会被侧连标记区间之外的标记变量吸收,同时不同的背景标记选择方法对作图结果的影响较大,并且难以推广到上位型互作QTL的定位。针对这些问题,笔者提出完备区间作图方法。本文介绍了该方法的遗传和统计原理,并通过一个大麦加倍单倍体群体说明其在定位加性QTL和加性×加性互作QTL中的应用。完备区间作图包含两个步骤:首先利用所有标记的信息,通过逐步回归选择重要的标记变量并估计其效应;然后利用逐步回归得到的线性模型校正表型数据,通过一维扫描定位加(显)性效应QTL,通过二维扫描定位上位型互作QTL。这种作图策略简化了复合区间作图中控制背景遗传变异的过程,提高了对QTL的检测功效。

分类号: S336

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