玉米LBD/ASL基因家族基因鉴定及抗旱表达分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 韩佳蕊

作者: 韩佳蕊;李昊;黄馨;钱步轩;刘洋;王梓钰;吴委林;张闯

作者机构: 延边大学农学院;吉林省农业科学院/试验地综合服务中心;通化县农民科技教育中心;吉林省农业科学院农业生物技术研究所/吉林省农业生物技术重点实验室

关键词: 玉米;LBD基因家族;干旱胁迫;转录因子;基因表达;共线性分析

期刊名称: 玉米科学

ISSN: 1005-0906

年卷期: 2024 年 32 卷 009 期

页码: 32-42

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过生物信息学方法,从Ensembl Plants数据库中鉴定出45个玉米LBD基因,并命名为ZmLBD1~ZmLBD45,探讨LBD/ASL基因家族在玉米中的功能及其在干旱胁迫中的作用。系统进化分析将这些基因分为Class I和Class II两大类,进一步细分为多个亚组。基因结构分析揭示,ZmLBD基因家族在外显子和内含子结构上具有多样性,并鉴定出10个保守基序。共线性分析表明,ZmLBD基因家族在进化过程中经历了多次基因重复事件,尤其在Class I亚家族中,重复基因对其扩展起到重要作用。RNA-Seq数据的表达分析显示,ZmLBD基因在不同组织和发育阶段的表达模式尤其在干旱胁迫下发生显著变化。

分类号: S513

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