花生颈腐病菌Diplodia gossypina全基因组序列资源(英文)

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王振宇

作者： 王振宇;冯兰兰;高蒙;王娜;李绍建;范腕腕;崔小伟;桑素玲;张海燕

作者机构：

关键词： 花生;颈腐病;棉色二孢;基因组测序分析;效应蛋白;SNF1

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2025 年 55 卷 003 期

页码： 365-379

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 花生（Arachis hypogaea）作为一种重要的油料作物，为人类提供了优质的植物油、蛋白质、膳食纤维、矿物质和维生素。然而，随着极端天气的频繁发生以及各类病原菌耐药性的增强，花生受到各种生物和非生物胁迫的影响。花生颈腐病的优势病原菌棉色二孢（Diplodia gossypina）为世界各地花生产区花生颈腐病的主要病原，可造成严重的产量损失。为探讨其发病机制，对D. gossypina A20＿4菌株进行了基因组测序分析。结果表明，D. gossypina A20＿4菌株基因组组装大小为43.03 Mb,GC含量为54.91%；从头组装共鉴定出10,745个基因，其中包含41,526个编码序列和2.20%的重复序列。其中6,461个基因（60.13%）被BlastP GO注释，3,245个基因（30.20%）被KOG注释，3,093个基因（28.79%）被KEGG注释。同时，本研究利用SignalP、TMHMM、EffectorP和PHI-base等软件对该菌株全基因组编码的10,745条蛋白序列进行了分泌蛋白和效应子的预测分析，结果表明，D. gossypina A20＿4基因组中有790个预测的分泌蛋白基因，利用dbCAN3等软件从这些分泌蛋白中分析鉴定到220个碳水化合物活性酶，以糖苷水解酶亚家族成员数量最多。分泌蛋白中效应蛋白的预测结果表明D. gossypina A20＿4中有224个潜在的效应蛋白，其中222个蛋白的功能可被PHI-base注释，根据注释结果在该菌株中找到12个关键致病因子。此外，利用生物信息学软件对其基因组中的一个丝氨酸/苏氨酸类蛋白激酶SNF1基因进行了鉴定和分析，初步分析结果显示该基因与细胞自噬进程高度相关，而自噬进程已经被证实参与调控真菌致病力。以上研究结果将为我们了解D. gossypina的进化、致病分子机制以及宿主-病原体相互作用提供新的见解。

分类号： S435.652

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