基于RAD-seq简化基因组测序的金湖乌凤鸡遗传进化研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 韩威

作者： 韩威;沈华伟;殷建玫;朱云芬;沈海玉;李国辉;薛倩;张会永;苏一军;窦新红;王克华;邹剑敏

作者机构：

关键词： 金湖乌凤鸡;简化基因组测序;遗传进化

期刊名称： 福建农林大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-5470

年卷期： 2020 年 02 期

页码： 206-211

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用RAD-seq简化基因组测序鉴定金湖乌凤鸡与其它18个地方鸡种、2个引入肉鸡品种的SNP标记,计算遗传统计量,分析金湖乌凤鸡的遗传多样性和遗传结构,鉴定受选择基因.结果表明,在金湖乌凤鸡中鉴定出SNP标记325 531个,SNP标记在染色体上均匀分布.金湖乌凤鸡的观察杂合度H_o为0.213 6、核苷酸多样度P_i为0.240 4,近交系数F_(is)为0.111 6,与其它18个地方鸡种相比遗传多样性较为丰富;金湖乌凤鸡的平均遗传分化系数F_(st)为0.155 6,平均基因流N_m为1.398 2,在系统发育树中形成一个相对独立的分支.通过F_(st)和θ_π检验,在金湖乌凤鸡中发现23个受选择区域,包含104个受选择基因,功能分析表明这些受选择基因主要富集在代谢过程、发育过程、细胞信号转导等生物学通路.

分类号： S831.2

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