绵羊MYL基因家族的鉴定与组织表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨杨

作者： 杨杨;余乾;刘昱成;杨华;赵卓;王立民;周平;杨庆勇;代蓉

作者机构：

关键词： 绵羊;MYL;基因家族;生物信息学分析;基因表达

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 1551-1564

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解肌球蛋白轻链（myosin light chain,MYL）基因家族在绵羊中的分子进化关系及表达变化，本研究利用生物信息学方法对绵羊MYL基因家族进行鉴定和系统分析。各选取了3只军垦白肉羊、新疆细毛羊和湖羊成年公羊各组织样品，采用qRT-PCR方法验证家族成员MYL1、MYL6B和MYLPF基因的表达情况。结果显示，12个MYL基因分布在9条染色体上，编码由147～211氨基酸组成的亲水性蛋白质，无信号肽和跨膜结构域，二级结构以α-螺旋为主。根据基因结构、保守结构域和基序分布等特征，可以将这些基因家族成员分为3个组。共线性分析结果表明，MYL2和MYL10、MYL2和MYLPF存在片段复制，且这些片段受到较强的选择压力。蛋白互作网络显示MYH10与绵羊MYL家族成员均存在互作关系。MYLs的组织表达模式差异较大，其中MYL1、MYL2、MYL6B和MYLPF在骨骼肌组织中高水平表达。基因克隆测序结果显示，扩增得到目的基因的CDS全长，qRT-PCR结果表明，MYL1、MYL6B和MYLPF在军垦白肉羊肌肉组织中的表达水平显著高于其他组织（P＜0.000 1）,并且在军垦白肉羊骨骼肌中的表达水平显著高于湖羊和细毛羊（P＜0.000 1）。以上结果为深入研究绵羊MYL基因家族的功能以及优化绵羊肉用性能提供了线索。

分类号： S826.2

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