雌雄鸡胚性腺microRNA表达检测及靶基因预测分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 何川

作者： 何川;赵乐乐;翟正晓;高宏巍;蒲弘俊;陈永灿;汤琳琳;杨凯旋;李世玉;黄启忠;孟和

作者机构：

关键词： 鸡胚;性腺;微小RNA;靶基因预测;第2代测序技术

期刊名称： 上海交通大学学报(农业科学版)

ISSN： 1671-9964

年卷期： 2012 年 30 卷 05 期

页码： 72-77

摘要： 动物胚胎发育时期伴随着复杂的基因表达和调控过程,特别是microRNA的基因转录后调控。实验应用二代测序技术测定了发育至6.5d雌雄鸡胚性腺中miRNA表达情况,并对差异表达miRNA进行了靶基因分析。检测分析结果显示,在雄性样品中发现375种miRNA,雌性样品中发现372种miRNA。针对30种在两性性腺中显著差异表达的miRNA,实验采用3个软件(Targetscan 6.0,MirTarget2与miRanda)进行靶基因预测分析,共预测出12 477个靶基因,这些基因显著富集在205个GO分类和11条信号通路中。实验为鸟类性别分化调控机制研究和miRNA靶基因分析提供了基本实验数据和方法学参考。

分类号： S831

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