EST-SNP开发软件特性分析及比较

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李猛

作者： 李猛;郭大龙;刘崇怀;张国海

作者机构：

关键词： SNP;软件分析;测序峰图;EST序列

期刊名称： 生命的化学

ISSN： 1000-1336

年卷期： 2011 年 06 期

页码： 150-155

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用生物信息学软件,对表达序列标签(EST)序列进行单核苷酸多态性(SNP)开发目前已较为普遍,其方法简单实用,且软件数量较多,可分为需要测序峰图的SNP开发软件和不需要测序峰图的SNP开发软件。对有测序峰图的序列进行SNP开发,操作步骤较少且结果较为精确;对无测序峰图的序列进行SNP开发可大批量操作且成本较低。本文针对这两类软件进行分析比较,阐述EST-SNP开发流程,重点分析以公共数据库中EST序列为基础的SNP开发过程,并对其各种使用参数加以说明,旨在为EST-SNP开发提供参考,提高效率。

分类号： Q811.4

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