白菜品种的SSR指纹图谱数据库的构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张婉

作者： 张婉;崔继哲;于拴仓;李丽

作者机构：

关键词： 白菜(Brassica campestris L.ssp.Pekinensis);SSR;核心引物;指纹图谱;数据库

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2013 年 06 期

页码： 189-203

收录情况： CSCD

摘要： 本研究利用SSR标记技术筛选出合适的核心引物,对70个白菜品种进行DNA指纹分析,构建白菜SSR指纹图谱数据库。首先从500对引物中筛选出80对具有多态性的引物,再从其中选取20对多态性高,稳定性好且均匀分布在白菜10条染色体上的核心引物进行PCR扩增,引物多态信息含量(polymorphism information content,PIC)平均为0.716,变化范围0.473~0.932,平均杂合率0.504 4。经PCR电泳检测统计得到的指纹图谱进行综合分析,形成各个白菜品种的SSR指纹代码,并且采用ClusterProject对构建的指纹图谱数据进行分析整理,得到各品种的指纹模式图谱,进而分析得到20个核心引物组合可以将70个白菜品种完全分开,并最终建立了白菜品种的SSR指纹图谱数据库。本研究构建的白菜品种SSR指纹图谱数据库,为建立白菜品种特异性、一致性及纯度的鉴定技术体系提供了基础依据。

分类号： S634.3

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