猪肺表面活性蛋白A的DNA全序列克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 乔莉娟

作者： 乔莉娟;王立贤;苏振环;颜华

作者机构：

关键词： 猪;SP-A基因;全序列克隆;生物信息学分析

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2008 年 39 卷 04 期

页码： 393-398

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 猪肺表面活性蛋白A(Porcine surfactant protein A,SP-A)是猪肺泡表面活性蛋白中含量最多、最先被发现具有炎症免疫调节功能的表面活性蛋白。本研究利用比较基因组学方法,设计了6对引物进行PCR扩增,克隆测序后进行拼接,获得了长为4037 bp猪SP-A基因的全序列(gi:DQ985806)。经生物信息学分析,此序列包含了猪SP-A基因启动子区,含有1个747 bp的完整开放阅读框,编码248个氨基酸;预测猪SP-A蛋白理论分子量约为26.37 ku,蛋白的等电点为5.20;在1~20位氨基酸可能是信号肽序列;在大约1~20、120~135、145~160位氨基酸存在疏水性区域;跨膜结构分析表明此蛋白所有氨基酸都位于膜表面;并且发现猪SP-A蛋白同人SP-A蛋白一样也含有保守的碳水化合物识别区、胶原样区域和茎区。本结果为进一步对SP-A与猪呼吸道疾病相关性的研究奠定了基础。

分类号： S828

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