猪肺表面活性蛋白A的DNA全序列克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 乔莉娟

作者： 乔莉娟;王立贤;苏振环;颜华

作者机构：

关键词： 猪;SP-A基因;全序列克隆;生物信息学分析

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2008 年 39 卷 04 期

页码： 393-398

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 猪肺表面活性蛋白A(Porcine surfactant protein A,SP-A)是猪肺泡表面活性蛋白中含量最多、最先被发现具有炎症免疫调节功能的表面活性蛋白。本研究利用比较基因组学方法,设计了6对引物进行PCR扩增,克隆测序后进行拼接,获得了长为4037 bp猪SP-A基因的全序列(gi:DQ985806)。经生物信息学分析,此序列包含了猪SP-A基因启动子区,含有1个747 bp的完整开放阅读框,编码248个氨基酸;预测猪SP-A蛋白理论分子量约为26.37 ku,蛋白的等电点为5.20;在1~20位氨基酸可能是信号肽序列;在大约1~20、120~135、145~160位氨基酸存在疏水性区域;跨膜结构分析表明此蛋白所有氨基酸都位于膜表面;并且发现猪SP-A蛋白同人SP-A蛋白一样也含有保守的碳水化合物识别区、胶原样区域和茎区。本结果为进一步对SP-A与猪呼吸道疾病相关性的研究奠定了基础。

分类号： S828

  • 相关文献

[1]母猪VEGF基因mRNA全序列的克隆与分析. 陈来华,王立贤,王立刚,季跃光,颜华,张龙超. 2008

[2]猪肺表面活性蛋白A基因启动子区的克隆及生物信息学分析. 晋大鹏,王立贤,张龙超,颜华,乔丽娟,程笃学,李勇. 2009

[3]猪SP-A基因荧光定量PCR检测方法的建立. 乔莉娟,王立贤,颜华. 2009

[4]猪精子发生候选基因PYGO2的分离、表达和亚细胞定位研究. 赵筱,张霞,范俐,杨忠,霍金龙,曾日彬,刘丽仙,霍海龙. 2021

[5]猪IGFBP3基因生物信息学分析. 许金根,胡洪,王重龙,李庆岗. 2021

[6]猪精氨酸-丝氨酸蛋白激酶1(SRPK1)克隆表达及功能初步分析. 俄广鑫,刘娣,张冬杰,杨秀琴,崔羽,祝继原,杨少成,王嘉博,谢宇彤. 2010

[7]大长杂交猪DJ-1基因克隆、生物信息学及表达分析. 炊林亚,夏博策,黄娇娇. 2022

[8]猪多潜能性维持因子5 cDNA全序列的克隆与分析. 李勇,王立刚,王立贤,乔丽娟,张龙超,颜华. 2010

[9]猪精氨酸-丝氨酸蛋白激酸3(SRPK3)基因的克隆、表达及多态性分析(英文). 俄广鑫,刘娣,张冬杰,崔羽. 2011

[10]猪多潜能性维持因子5cDNA全序列的克隆与分析. 李勇,王立刚,王立贤,乔丽娟,张龙超,颜华. 2010

[11]猪Lbx2基因的克隆、序列分析及表达. 晁哲,郑心力,孙瑞萍,魏立民,刘圈炜,刘海隆,黄丽丽,王峰. 2013

[12]猪CREBRF基因生物信息学和表达规律分析. 郭肖蓉,刘颖,樊佳珍,黄涛,周荣. 2024

[13]猪CRTC2基因的分子生物学特征及其功能预测分析. 王冰洁,韩娜,韦怡林,齐昆龙,常乐彬,张哲,李新建,李秀领,王克君,乔瑞敏,杨峰,韩雪蕾. 2025

[14]两种新型快速检测猪SP-A基因方法的建立及对比. 马妍妍,彭永刚,宋铭忻,崔尚金. 2014

[15]甘蔗核苷二磷酸激酶(NDPK1)基因克隆及表达分析. 李杨瑞,杨丽涛. 2012

[16]花生谷氨酸脱氢酶基因AhGDH1的克隆与生物信息学分析. 陈湘瑜,徐日荣,林栩松,唐兆秀. 2016

[17]灰毡毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克隆、生物信息学和表达分析. 蔡嘉洛,朱贻霖,陈林,樊悦,刘峰,张亚丽,欧阳琳,刘湘丹. 2016

[18]柞蚕腺苷酸转移酶基因的克隆与序列分析. 李玉萍,王欢,武松,夏润玺,刘彦群,秦利,李喜升,姜德富. 2009

[19]大豆FLAs蛋白理化性质和结构特征的生物信息学分析. 吴小明,胡颖. 2017

[20]栽培种花生FAE1基因的克隆和序列分析. 张欣,孙全喜,吴琪,王秀贞,胡东青,唐月异,王志伟,宋国生,徐建志,殷冬梅,王传堂. 2018

作者其他论文 更多>>

微信小程序