苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 杨晓琳
作者: 杨晓琳;段迎;蔡苏云;贺润丽;尹桂芳;王艳青;卢文洁;孙道旺;王莉花
作者机构: 山西中医药大学中药与食品工程学院;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室
关键词: 苦荞;漆酶;基因克隆;生物信息学;表达分析
期刊名称: 作物杂志
ISSN: 1001-7283
年卷期: 2022 年 003 期
页码: 73-79
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 利用RT-PCR技术从苦荞中克隆出2条漆酶(laccase)基因,运用生物信息学技术对2个基因序列进行分析,预测结构域、二级和三级蛋白结构,进行蛋白同源比对及进化树分析。结果表明,FtLAC-1基因序列开放阅读框为1695bp,编码564个氨基酸,FtLAC-2基因序列开放阅读框为1707bp,编码568个氨基酸。FtLAC-1和FtLAC-2蛋白预测分子量分别为61.41和62.47kDa,理论等电点分别为9.45和9.41,为亲水性蛋白,2个基因序列相似性较低,氨基酸序列同源性不高。qRT-PCR分析出其在苦荞不同组织器官存在差异性表达。结论为进一步探索FtLAC-1和FtLAC-2在苦荞薄果壳形成中的功能提供理论基础。
分类号: S517
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