苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨晓琳

作者： 杨晓琳;段迎;蔡苏云;贺润丽;尹桂芳;王艳青;卢文洁;孙道旺;王莉花

作者机构：

关键词： 苦荞;漆酶;基因克隆;生物信息学;表达分析

期刊名称： 作物杂志

ISSN： 1001-7283

年卷期： 2022 年 003 期

页码： 73-79

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用RT-PCR技术从苦荞中克隆出2条漆酶（laccase）基因，运用生物信息学技术对2个基因序列进行分析，预测结构域、二级和三级蛋白结构，进行蛋白同源比对及进化树分析。结果表明，FtLAC-1基因序列开放阅读框为1695bp，编码564个氨基酸，FtLAC-2基因序列开放阅读框为1707bp，编码568个氨基酸。FtLAC-1和FtLAC-2蛋白预测分子量分别为61.41和62.47kDa，理论等电点分别为9.45和9.41，为亲水性蛋白，2个基因序列相似性较低，氨基酸序列同源性不高。qRT-PCR分析出其在苦荞不同组织器官存在差异性表达。结论为进一步探索FtLAC-1和FtLAC-2在苦荞薄果壳形成中的功能提供理论基础。

分类号： S517

  • 相关文献

[1]苦荞FtHCT的基因克隆与生物信息学分析. 杨晓琳,段迎,蔡苏云,贺润丽,尹桂芳,王艳青,卢文洁,孙道旺,王莉花. 2023

[2]苦荞FtERF基因克隆、生物信息学及其表达分析. 张俊,蔡苏云,徐子豪,侯蕾,贺润丽,尹桂芳,王莉花,王艳青,卢文洁,孙道旺. 2024

[3]烟草NtMYB44b转录因子基因克隆以及生物信息学和表达分析. 余婧,郭玉双,雷波,张孝廉,赵德刚. 2020

[4]大豆胞囊线虫病抗性候选基因GmPEBP4-1克隆及表达分析. 郭杨,陈立新,姜海鹏,战宇航. 2020

[5]巴西橡胶树生长素响应HbJAR1基因克隆与表达分析. 李晓娜,肖厚贞,万三连,张冬,张宇. 2017

[6]石榴PAL基因的克隆与表达分析. 冯立娟,尹燕雷,焦其庆,杨雪梅. 2018

[7]茶树漆酶基因CsLAC4和CsLAC12的克隆与表达分析. 黄晨,陈帅,程小芳,张新,黎星辉,孙晓玲. 2018

[8]来源于枯草芽孢杆菌的漆酶 cotA 基因克隆与表达及其酶学性质研究. 余小霞,刘晓青,田健,伍宁丰. 2015

[9]白腐菌漆酶基因的克隆及其在酵母中的表达研究. 张银波,江木兰,胡小加,马立新. 2004

[10]来源于枯草芽孢杆菌的漆酶cotA基因克隆与表达及其酶学性质研究. 余小霞,刘晓青,田健,伍宁丰. 2015

[11]来源于土壤宏基因组中漆酶Lac13H9基因克隆及其酶学性质分析. 胡斌斌,吴萍,刘晓青,丁伟,伍宁丰. 2015

[12]特异腐质霉来源漆酶基因的克隆及其在毕赤酵母中的表达. 张丽洁,徐欣欣,田健,初晓宇,朱宝成,伍宁丰. 2019

[13]苦荞查尔酮合成酶基因序列特征及分子进化分析. 孙朝霞,侯思宇,郭彬,令狐斌,黄可盛. 2014

[14]苦荞中查尔酮合成酶基因(CHS)的克隆. 高帆,张宗文,李艳琴,吴斌,宋韡. 2011

[15]牵牛E3泛素连接酶PNRma1基因的克隆及抗旱相关性分析. 代锦绣,董轩名,倪欢欢,董延龙,金晓霞. 2017

[16]miR-18a-5p在鸡不同生长时期的表达及其生物信息学分析与靶基因预测. 黄正洋,黄华云,穆春宇,李春苗,王钱保,黎寿丰,赵振华. 2021

[17]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021

[18]大白菜TPS基因家族鉴定及其在高温胁迫下的表达分析. 庞强强,蔡兴来,孙晓东,张文,周曼. 2020

[19]大豆GmGLRs基因全基因组鉴定与表达分析. 崔晓霞,赵硕,郭书巧,束红梅,何晓兰,倪万潮,巩元勇,刘来华. 2019

[20]板栗PPO基因克隆及生物信息学分析. 程丽莉,程运河,兰彦平,曹庆昌,胡广隆,苏淑钗. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序