苦荞FtERF基因克隆、生物信息学及其表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张俊

作者： 张俊;蔡苏云;徐子豪;侯蕾;贺润丽;尹桂芳;王莉花;王艳青;卢文洁;孙道旺

作者机构：

关键词： 苦荞;乙烯响应因子;生物信息学;表达分析

期刊名称： 作物杂志

ISSN： 1001-7283

年卷期： 2024 年 002 期

页码： 23-29

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 乙烯响应因子对植物发育和细胞代谢具有重要作用.通过RT-PCR从苦荞中克隆出ERF基因,对其进行生物信息学分析和差异表达分析.结果表明,FtERF基因开放阅读框长度为729bp,编码了 243个氨基酸,编码的蛋白分子量26.08kD,等电点9.22,属于亲水性蛋白.FtERF不含有信号肽和跨膜螺旋结构,亚细胞定位在细胞核内,蛋白质二级结构和三级结构高度相似.FtERF含有抑制基序DLNxxP,系统进化表明FtERF和ERF4关系较近.经荧光定量表达发现,厚壳苦荞不同部位表达均高于薄壳苦荞,苦荞发育成熟期表达高于非成熟期.

分类号： S517

  • 相关文献

[1]苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析. 杨晓琳,段迎,蔡苏云,贺润丽,尹桂芳,王艳青,卢文洁,孙道旺,王莉花. 2022

[2]苦荞FtHCT的基因克隆与生物信息学分析. 杨晓琳,段迎,蔡苏云,贺润丽,尹桂芳,王艳青,卢文洁,孙道旺,王莉花. 2023

[3]香蕉MaERF-1基因的克隆、序列分析及表达载体构建. 金志强,徐碧玉,黄东梅,胡伟,李凯,许奕. 2017

[4]牵牛E3泛素连接酶PNRma1基因的克隆及抗旱相关性分析. 代锦绣,董轩名,倪欢欢,董延龙,金晓霞. 2017

[5]miR-18a-5p在鸡不同生长时期的表达及其生物信息学分析与靶基因预测. 黄正洋,黄华云,穆春宇,李春苗,王钱保,黎寿丰,赵振华. 2021

[6]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021

[7]大白菜TPS基因家族鉴定及其在高温胁迫下的表达分析. 庞强强,蔡兴来,孙晓东,张文,周曼. 2020

[8]烟草NtMYB44b转录因子基因克隆以及生物信息学和表达分析. 余婧,郭玉双,雷波,张孝廉,赵德刚. 2020

[9]大豆GmGLRs基因全基因组鉴定与表达分析. 崔晓霞,赵硕,郭书巧,束红梅,何晓兰,倪万潮,巩元勇,刘来华. 2019

[10]板栗PPO基因克隆及生物信息学分析. 程丽莉,程运河,兰彦平,曹庆昌,胡广隆,苏淑钗. 2020

[11]罗汉果3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因的克隆及表达分析. 荆礼,赵欢,莫长明,苏航,唐秋竹,张鹤. 2020

[12]芒果中性/碱性转化酶MiNI基因的克隆与表达分析. 郭利军,邓会栋,冯学杰,罗志文,陈哲,范鸿雁,胡福初,华敏. 2020

[13]SiASRs家族基因的鉴定及表达分析. 宋健,曹晓宁,王海岗,陈凌,王君杰,刘思辰,乔治军. 2019

[14]番茄WRKY转录因子in silico鉴定及表达分析. 万红建,俞锞,袁伟,刘云飞,叶青静,王荣青,阮美颖,姚祝平,杨悦俭. 2013

[15]大豆胞囊线虫病抗性候选基因GmPEBP4-1克隆及表达分析. 郭杨,陈立新,姜海鹏,战宇航. 2020

[16]蓖麻GRF转录因子家族生物信息学鉴定及表达分析. 代梦媛,高梅,李文昌. 2021

[17]辣椒紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定与表达特征. 程远,郭勤卫,郑佳秋,万红建. 2017

[18]花生赤霉素3-β-双加氧酶(AhGA3ox)基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 李海芬,鲁清,刘浩,温世杰,王润风,黄璐,陈小平,洪彦彬,梁炫强. 2024

[19]木薯FRK1类似基因的分离及表达分析. 吴金山,陆小静,王思琦,黄家权,张逸杰,贾迎雪,陈银华. 2023

[20]大蒜WRKY基因家族的鉴定与生物信息学分析. 隋淑梅,黄思杰,田洁. 2023

作者其他论文 更多>>

微信小程序