水生生物DNA序列相似度的算法

文献类型： 中文期刊

第一作者： 于喆

作者： 于喆

作者机构：

关键词： DNA序列相似度指标;水生生物;MonteCarlo模拟

期刊名称： 水产学杂志

ISSN： 1005-3832

年卷期： 2016 年 29 卷 05 期

页码： 22-26

摘要： 本文提出DNA序列相似度指标,建立DNA序列比对算法。首先,将水生生物DNA样本序列与现有的基因库中的DNA序列逐项比对;其次,在满足特定阈值条件下,确认样本序列的分类。利用Java编程语言来实现算法,通过MonteCarlo模拟和实际应用,验证算法的有效性。理论结果表明:在满足特定阈值条件下,通过计算DNA序列相似度,能够确定数据库中与未知DNA样本序列最相似的序列,判断样本序列的分类。模拟实验、对比研究和应用结果表明:相似度指标算法在有效判别DNA序列的分类,提高DNA序列匹配成功率,降低程序复杂度等方面具有优良特征。

分类号： S917

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