奥利亚罗非鱼卵巢芳香化酶基因的克隆、序列分析和结构预测

文献类型: 中文期刊

第一作者: 唐永凯

作者: 唐永凯;李建林;陈文华;俞菊华

作者机构:

关键词: 奥利亚罗非鱼;快速扩增cDNA末端;P450芳香化酶

期刊名称: 上海水产大学学报

ISSN: 1004-7271

年卷期: 2008 年 15 卷 04 期

页码: 411-417

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用RT-PCR和RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)法分离出奥利亚罗非鱼卵巢芳香化酶(P450aromA)的全序列,得到1784 bp的全长cDNA,包括38 bp 5’非翻译区,1566 bp阅读框以及含Poly(A)信号(AATAAA)的167 bp 3’非翻译区[不包括Poly(A)]。阅读框共编码521个氨基酸,计算的蛋白质分子量为59 ku。同源性分析显示,奥利亚罗非鱼P450aromA的氨基酸序列与其它鱼性腺P450arom具有70%以上的同源性,与其它鱼脑P450arom为60%左右同源,但芳香化酶高保守区包括I-螺旋区,芳香化酶特异保守区II和血红素结合区III和其它鱼芳香化酶的同源性分别高达83%~96%,78%~86%和85~100%。系统发育分析表明奥利亚罗非鱼P450aromA与鱼类性腺P450arom属于同一分支的。生物信息学分析显示:奥利亚罗非鱼P450A基因编码的蛋白无信号肽,无跨膜区域,为非分泌蛋白,同时含有多个酪蛋白激酶II磷酸化位点,N-糖激化位点,N-肉豆蔻酰化位点,蛋白激酶C磷酸化位点。

分类号: S917.4

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