中国南瓜BZR基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 李春

作者: 李春;刘小俊;蔡鹏;李跃建;房超;刘独臣;梁根云

作者机构:

关键词: 中国南瓜;油菜素内酯;BZR基因家族;生物信息学分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN:

年卷期: 2022 年 019 期

页码:

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 油菜素唑抗性因子(BZR)是植物激素油菜素内酯信号转导途径中的关键转录因子,通过激活相关基因的表达,调控植物的生长发育和环境响应。为了解析中国南瓜BZR基因家族的特征,本研究使用生物信息学技术鉴定中国南瓜基因组中BZR基因家族成员并进行理化性质、染色体定位、共线性、系统发育、基因结构、保守基序和顺式作用元件分析。结果显示,中国南瓜基因组中共有8个BZR基因家族成员,理化性质差异不明显;8个BZR基因均匀分布在中国南瓜的染色体上;系统发育分析显示8个BZR蛋白构成两个支系,结合共线性分析表明中国南瓜8个BZR基因可能是基因复制的结果。基因结构和保守基序分析显示中国南瓜的BZR基因之间差异不明显;顺式作用元件分析显示中国南瓜8个BZR基因家族成员可能在中国南瓜油菜素内酯信号转导途径中扮演不一样的角色。研究结果为进一步研究中国南瓜BZR基因家族生物学功能提供参考。

分类号: S642.1

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