谷子TCP基因家族成员序列特征及表达模式分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 连卜颍

作者： 连卜颍;王喆;韩尚玲;侯思宇;韩渊怀;李红英

作者机构：

关键词： 谷子(Setaria italica);TCP;转录因子;生物信息学分析;基因表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 03 期

页码： 710-718

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为深入解析谷子TCP基因家族的功能,通过生物信息学方法对谷子TCP转录因子家族基因成员序列特征、基因结构、染色体定位、系统进化关系及表达模式进行分析。结果表明:除第8染色体之外,从谷子基因组上其余8条染色体中共鉴定出26个TCP家族成员,并根据其在染色体的顺序和位置先后进行命名,其中分布在第3和第5染色体上的TCP家族成员数量最多,高达5个。不同家族成员其编码的氨基酸残基数目具有明显差异,范围为95 aa～451 aa。其中SiTCP21基因编码氨基酸残基数目最少为95个氨基酸;而SiTCP15最多为451个氨基酸残基。26个TCP家族成员的蛋白结构中均含有bHLH保守结构域。基因表达分析结果表明,31%的成员在穗中的表达量明显高于其他组织,因此推测该基因家族可能对谷子穗部生长发育的调控起关键作用。本研究对深入研究Si TCPs家族基因的功能奠定了基础,也为谷子生长发育的调控机制提供了新的思路。

分类号： Q943.2`S515

  • 相关文献

[1]大豆两个C2H2型转录因子基因序列特征及表达分析. 侯思宇,孙朝霞,郭彬,王玉国,李贵全,韩渊怀. 2014

[2]玉米转录因子在调控植物内源活性氧和抗非生物逆境反应中的作用. 赵军,王磊,张霞,王颖,范云六. 2004

[3]高粱GATA转录因子家族的鉴定和表达模式分析. 姚茂星,周光怡,丁延庆,李魁印,任明见. 2022

[4]金线莲ArCRC基因的克隆、亚细胞定位和表达分析. 林江波,邹晖,黄惠明,李和平,戴艺民. 2025

[5]玉米VOZ基因家族的鉴定与生物信息学分析. 时丕彪,胡凤琴,蒋润枝,吕远大. 2021

[6]棉花转录因子基因GhMYBPA1的克隆及表达分析. 张安红,赵战胜,王志安,肖娟丽,刘圆,罗晓丽. 2020

[7]葡萄SBP-box转录因子家族的生物信息学分析及其应答激素调控葡萄果实成熟的作用. 崔梦杰,王晨,冷翔鹏,吴伟民,汤崴,张文颖,朱旭东,贾海锋,沈文飚,房经贵. 2018

[8]基于转录组的洋葱bHLH转录因子家族鉴定与生物信息学分析. 陈微,潘美红,惠林冲,李威亚,郇国磊,何林玉,缪美华,陈振泰,杨海峰. 2023

[9]甘薯近缘野生种三浅裂野牵牛WRKY基因家族的生物信息学分析. 杜泰峰,侯夫云,秦桢,王庆美,张立明. 2021

[10]大豆GeBP转录因子家族基因生物信息学分析. 张军,尹珺伊,王岩,田秋丰,刘秋瑾,何佳琦,黄宇翔,王丽坤,史同瑞,翟莹. 2021

[11]大麦SRO家族的全基因组鉴定及生物信息学分析. 李志强,聂石辉,王仙,向莉,刘恩良,方伏荣. 2022

[12]蓖麻WRKY14基因的鉴别与信息分析. 黄启星,郭安平,杨礼富,邹智. 2012

[13]绿豆bHLH转录因子家族的鉴定与生物信息学分析. 陈红霖,胡亮亮,王丽侠,王素华,程须珍. 2017

[14]ARF类转录因子GhARF3的生物信息学分析. 陈蔷,彭明. 2009

[15]黄瓜WIP转录因子家族基因的鉴定及表达分析. 韩瑞月,刘晓林,辛同旭,李森,杨学勇,孙进京. 2025

[16]谷子SiSAP8基因的克隆及dCAPS标记开发. 王亦学,郝曜山,张欢欢,董艳辉,王晓清,孙毅. 2020

[17]谷子转录因子SiNF-YA6的过表达提高转基因植株对低氮胁迫的抗性. 方广宁,胡利芹,王二辉,薛飞洋,马有志,徐兆师,李连城,周永斌,刁现民,贾冠清,陈明,闵东红. 2015

[18]气相色谱-串联质谱法测定白蚁预防工程土壤中毒死蜱及其代谢物残留. 张文童,杨嘉理,王瑊,荣飞,王文晶,张新平,杨志兰,章虎. 2020

[19]玉米TCP家族基因生物信息学鉴定与分析. 王玉红,徐立华,李军. 2014

[20]花对饲料中不同无机磷源的利用率. 赵朝阳,周洪琪,徐跑,陈建明,叶金云,李红霞. 2008

作者其他论文 更多>>

微信小程序