杏褪绿卷叶植原体新疆分离物核糖体蛋白基因的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 韩剑

作者： 韩剑;+;陈杭;+;艾克热木·买买提;罗明;唐章虎

作者机构：

关键词： 杏;杏褪绿卷叶病;植原体;核糖体蛋白基因;序列分析

期刊名称： 生物安全学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 001 期

页码： 36-42

收录情况： CSCD

摘要： 【目的】了解杏褪绿卷叶植原体新疆分离物的系统发育关系及遗传分化,确定其分类地位。【方法】利用植原体核糖体蛋白（rp）基因的特异性引物rp F1/rp R1对新疆轮台县托克逊县杏褪绿卷叶病植株总DNA进行PCR扩增,并对部分扩增片段克隆、测序及序列分析。【结果】获得杏褪绿卷叶植原体新疆分离物rp基因片段大小为1196 bp,该片段包含部分rp S19以及rp L22和rp S3基因的全部序列。序列相似性和系统进化分析表明,杏褪绿卷叶植原体新疆分离物与16SrⅤ-rp亚组中的各代表性植原体的rp基因核苷酸序列相似性达到95.7%～99.3%,其中与rpⅤ-C亚组的甜樱桃绿化植原体和枣疯病植原体的相似性最高,核苷酸及氨基酸相似性分别达到99.2%～99.3%和98.3%～98.4%。进一步虚拟RFLP分析,发现杏褪绿卷叶植原新疆分离物rp基因的酶切图谱与rpⅤ-C亚组成员相似性最高,但在MseⅠ、SspⅠ和TaqⅠ的酶切位点上存在差异。综上初步判断其可能属于16SrⅤ组（榆树黄化组）中的一个新rp亚组。【结论】本研究首次报道了杏褪绿卷叶植原体新疆分离物的rp基因序列,确定了其分类地位,为杏褪绿卷叶病的早期诊断和检测提供了基础。

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