华南地区猪流行性腹泻病毒的分子流行病学调查与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王栓群

作者： 王栓群;孙瑞芹;刘燕玲;夏平安;宋长绪

作者机构：

关键词： 猪流行性腹泻病毒;分子流行病学;基因进化分析

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2015 年 42 卷 06 期

页码： 97-104

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解华南地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行、变异及进化情况,从该地区的不同猪场采集2 159份样品,利用RT-PCR方法检测PEDV,扩增了部分PEDV阳性样品中的S、M和ORF3基因并测序,利用生物信息学软件进行序列分析。结果显示,PEDV在猪场中的检出率为100%,在所有样品中的平均检出率为53.0%,在哺乳仔猪、断奶仔猪、育肥猪和母猪样品中,PEDV平均阳性率分别为67.6%、42.8%、12.8%和47.2%。根据S、ORF3和M基因建立的进化树,PEDV可分为2个基因群,其中当前样品株为一群,韩国、美国和中国的参考毒株为一群。结果表明,PEDV在华南地区猪场普遍存在,其基因也在不断发生变化。

分类号： S852.651

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