托佩克猪SLA-2基因克隆及功能区生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 白婧

作者： 白婧;许崇波;张强;高凤山

作者机构：

关键词： 托佩克猪;SLA-2基因;克隆;功能区;生物信息学

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2011 年 0 卷 08 期

页码： 133-139

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究托佩克猪SLA-2基因功能,设计引物,克隆了该品系猪SLA-2基因(SLA-2-TPK)cDNA全长序列,并通过分子生物学软件分析其基因特征。结果显示,SLA-2-TPK cDNA全长为1 119 bp,其中3-1 097为编码区,共编码364个氨基酸,分别在第125、188、227和283位置出现半胱氨酸残基,含有两对链内二硫键。氨基酸同源性分析显示,SLA-2-TPK与其他SLA-2、SLA-3和SLA-1序列的同源率分别为86.0%-98.9%、85.0%-89.4%和84.2%-91.7%。系统进化树显示,SLA-2-TPK与韩国品系猪DQ883211遗传距离较近;各功能区分析,SLA-2-TPK与人HLA-A2和小鼠H-2K分子结构相似,且保留了人HLA-A2基因的部分功能位点。结果表明,SLA-2-TPK是典型的SLA-2等位基因,在进化程度上接近于部分韩国品系猪。

分类号： S828`Q78

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