海南普通野生稻遗传多样性分析及核心种质构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 翟李楠

作者： 翟李楠;唐清杰;周帮纪;周世圳;王惠艰;云勇;韩义胜;王晴瑜;严小微;邢福能

作者机构：

关键词： 海南普通野生稻;SSR标记;遗传多样性;核心种质

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2024 年 25 卷 010 期

页码： 1624-1636

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为摸清海南省众多普通野生稻材料之间的亲缘关系，发掘具有代表性的样本，本研究利用32个SSR标记，对来自海南省11个不同市县的2038份海南普通野生稻资源进行遗传多样性分析及核心种质构建。结果显示，平均有效等位基因（Ne,Number of effective alleles）为2.479，丰富度Shannon指数（I,Shannon entropy index）为0.975,Nei′s基因多样性（h,Nei′s genetic diversity）为0.570，多态性位点百分比为96.27%，表明海南普通野生稻的遗传多样性十分丰富。不同地方来源的海南普通野生稻遗传多样性存在差异，来自临高的海南普通野生稻丰富度最高，琼海的普通野生稻遗传丰富度最低，其变异主要集中在群体内部。群体结构分析显示当K=2时，Delta K值最高，将2038份海南普通野生稻资源分成2个类群，第Ⅰ类群有1145份资源，分别来源于海口、澄迈、儋州、三亚、万宁、琼海、临高、陵水、乐东、东方，第Ⅱ类群有893份资源，分别来源于海口、文昌和澄迈。利用居群优先及多次聚类的方法构建海南普通野生稻核心种质192份，占总资源（2038份）的9.42%，核心种质的Shannon指数（I）保留了102.46%,Nei′s基因多样性（h）保留了104.39%，有效降低了原始种质的遗传冗余度和遗传差异上的重复。海南普通野生稻核心种质代表了原种质的遗传多样性和特异性，为海南普通野生稻资源的有效利用提供材料。

分类号： S511.9

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