基于SSR分子标记的福建百香果品种(系)鉴定及指纹图谱构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 魏秀清

作者： 魏秀清;李亮;熊亚庆;许玲;章希娟;陈志峰;宋奇洁;许家辉

作者机构：

关键词： 百香果;SSR分子标记;品种鉴定;指纹图谱

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2022 年 010 期

页码： 1288-1297

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】基于SSR分子标记鉴别福建百香果品种的遗传多样性，构建福建百香果品种的分子指纹图谱。【方法】基于转录组测序，开发西番莲SSR分析标记，并筛选出15个重复性好、多态性高的分子标记用于17个福建百香果品种（系）鉴定及遗传多态性分析，构建百香果品种（系）的SSR分子指纹图谱。【结果】利用MISA软件对1 kb以上的24 319条西番莲（Passiflora caerulea L.） Unigene进行搜索，于8 742条Unigene上检测出11 385个SSR位点，出现频率为46.82%，平均分布距离为7.15 kb。单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸分别占总SSR的63.72%、20.40%和14.28%，为数量较大的优势重复基序，其优势重复基元分别为A/T、 AG/CT和AAG/CTT。通过Primer 3.0共获得出28 257对SSR引物。从26对有效扩增引物中选择重复性好的15对引物，对17份百香果品种（系）进行多态性验证分析。15对SSR引物共产生235条多态性条带，PIC平均值为0.95。利用UPGMA进行聚类分析并作图，在遗传距离0.765处，可将17个品种（系）分为7个类群。根据15对多态性引物扩增电泳图，选出PFSSR20和PFSSR29引物组合用于构建DNA指纹图谱，可鉴别出17个百香果品种（系）。【结论】利用西番莲转录组数据构建的SSR分子标记具有较高的多态性潜能，类型丰富，本研究基于此构建的DNA指纹图谱可分辨出17个百香果品种（系）。

分类号： S667.9

  • 相关文献

[1]利用SSR标记构建湖南省审杂交水稻品种DNA指纹图谱. 朱克永,刘之熙,李召华,曾曙珍,詹庆才. 2011

[2]SSR分子标记技术在棉种真实性和纯度鉴定上的研究进展. 匡猛,许红霞,王延琴,周大云,冯新爱,方丹,杨伟华. 2012

[3]基于SSR标记的MCID法鉴定中国自主选育的葡萄品种. 魏新科,樊秀彩,王晨,刘崇怀. 2019

[4]利用SSR分子标记构建苏香粳1号的指纹图谱. 朱勇良,黄凌哲,谢裕林,吴建祥,乔中英,王建平,黄萌,陈培峰. 2012

[5]我国芒果主栽品种遗传多样性分析及指纹图谱构建. 王明,应东山,王琴飞,李莉萍,张如莲. 2015

[6]我国部分蓖麻品种遗传资源SSR分析及DNA指纹图谱. 薛建峰,谭美莲,严明芳,汪磊,傅春玲,王力军,严兴初. 2015

[7]江苏中烟核心原料产区烤烟品种遗传分析及分子身份证构建. 田震,李媛,孙晋浩,任民,李少鹏,张兴伟,赵才能,钱建财,刘国祥. 2023

[8]基于SSR分子标记的龙眼种质资源遗传多样性分析及其指纹图谱构建. 郭栋梁,黄石连,王静,韩冬梅,李建光. 2022

[9]基于石蒜属转录组序列的SSR分子标记开发应用. 李青竹,蔡友铭,张永春,许俊旭,杨柳燕,孙翊. 2021

[10]我国芒果主栽品种遗传多样性分析及指纹图谱构建（英文）. 王明,应东山,王琴飞,李莉萍,张如莲. 2016

[11]43个福建省茶树品种指纹图谱构建及遗传多样性分析. 陈志辉,单睿阳,游小妹,林郑和,钟秋生,陈常颂. 2017

[12]甘蔗(Saccharum officinarum L.)品种遗传差异的AFLP分子标记分析. 谭裕模,李杨瑞,李容柏,高国庆. 2004

[13]用AFLP分子标记技术鉴别甘蔗(Saccharum of ficinarum L.)品种. 谭裕模,李杨瑞,李容柏,高国庆. 2003

[14]利用SSR构建甜菜品种的分子身份证. 栗媛,王茂芊,邳植,吴则东. 2019

[15]部分两用桃品种(系)指纹图谱的建立. 李雪莲,王尚德,刘佳棽,兰彦平,康向阳. 2010

[16]基于高通量芯片的大麦高效KASP标记的开发和应用. 徐婷婷,孟珊,朱小品,邹淑琼,狄佳春,杨欣,朱银,郭春滨,颜伟. 2024

[17]利用SSR分子标记建立杂交水稻指纹图谱. 宋书锋,刘全胜,付岳峰,符习勤,戴恒. 2008

[18]11个德国甜菜品种指纹图谱的构建. 吴则东,王华忠,马龙彪,王茂芊. 2013

[19]利用SSR标记鉴定柚和杂柑品种. 雷天刚,何永睿,吴鑫,刘小丰,许兰珍,彭爱红,陈善春. 2007

[20]湖南省审定的杂交稻品种DNA指纹图谱的构建与分析. 朱克永,詹庆才. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序