基于WGCNA探讨葛根素对呕吐毒素诱导C6细胞损伤的保护作用
文献类型: 中文期刊
第一作者: 赵海平
作者: 赵海平;刘林;王昕璐;岳鹏飞;孔维军;王蒙
作者机构:
关键词: 呕吐毒素;葛根素;加权基因共表达网络分析;C6细胞
期刊名称: 生物技术通报
ISSN: 1002-5464
年卷期: 2024 年 40 卷 009 期
页码: 301-310
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: [目的]利用呕吐毒素(deoxynivalenol,DON)构建C6 细胞损伤模型,分析葛根素(puerarin,PUE)对DON诱导C6 细胞损伤的保护作用机制.[方法]通过RNA测序(RNA-seq)和加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),挖掘与PUE缓解DON诱导C6 细胞损伤最相关的关键模块和关键核心靶点基因,探究PUE缓解DON诱导的神经毒性作用的分子机制.[结果]PUE可以显著抑制DON诱导的C6 细胞活力下降,对损伤的C6 细胞形态有所恢复,可有效缓解DON诱导的C6细胞损伤.RNA-seq和WGCNA结果表明,Blue模块是与PUE缓解DON诱导C6细胞损伤表型最相关的关键模块,从中筛选出S100a11、Pdia3、Hsp90b1 等基因是PUE发挥对DON诱导C6 细胞损伤保护作用的关键核心基因.[结论]PUE可能是通过靶向关键核心基因参与内质网中的蛋白质加工途径从而缓解DON诱导的C6 细胞损伤.
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