糜子SBP基因家族全基因组鉴定及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 段政勇
作者: 段政勇;丁敏;王宇卓;丁艺冰;陈凌;王瑞云;乔治军
作者机构:
关键词: 糜子;SBP基因;全基因组鉴定;基因表达分析
期刊名称: 植物学报
ISSN: 1674-3466
年卷期: 2024 年 002 期
页码: 231-244
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: SBP(squamosapromoterbindingprotein)家族广泛参与植物生长发育、信号转导及多种生理生化过程。从糜子(Panicum miliaceum)全基因组中筛选并鉴定到25个SBP基因。系统发育分析表明, PmSBP家族成员分为6个亚家族。同一亚家族成员具有相似的基因结构和保守基序。共线性分析表明,PmSBP与拟南芥(Arabidopsisthaliana)AtSBP和水稻(Oryzasativa)OsSBP分别形成7对和31对直系同源基因。顺式作用元件分析表明,PmSBP启动子区富含逆境胁迫、光反应及激素信号响应元件。基因表达模式分析表明, PmSBP基因表达具有明显的组织特异性、品种特异性及发育阶段特异性,表明SBP基因在糜子生长发育中发挥重要作用。研究结果为揭示SBP基因在糜子生长发育中的生物学功能奠定了基础,也为其它作物SBP基因研究提供了借鉴参考。
分类号: S516%Q943.2
- 相关文献
[1]小麦几丁质酶基因家族的全基因组鉴定及禾谷镰刀菌胁迫下的表达分析. 徐武,刘建丰,张戈,徐文,袁祖丽. 2019
[2]辣椒BES1基因家族鉴定及表达分析. 孟纯阳,魏小春,赵艳艳,原玉香,王志勇,杨双娟,姜俊,张晓伟. 2019
[3]菜用大豆液泡膜内在蛋白(TIPs)基因鉴定及表达分析. 冯志娟,徐盛春,刘娜,张古文,胡齐赞,龚亚明. 2018
[4]大豆分枝相关CYC/TB1-Like(CYL)基因鉴定及菜用大豆品种的激素表达谱分析. 冯志娟,刘娜,张古文,徐盛春,龚亚明. 2019
[5]葡萄CHX基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析. 杜宜洋,连红娟,李晓梅,谭敏,杨镕兆,刘政海,杨兆亮,唐晓萍,董志刚,李捷. 2020
[6]大豆NIP类水孔蛋白基因的鉴定及表达特性分析. 吴伟,冯志娟,徐盛春,刘娜,张古文,胡齐赞,龚亚明. 2018
[7]玉米GATA基因家族的全基因组鉴定及热胁迫下的表达分析. 王延召,周波,韩小花,黄保,鲁晓民,程军玲,王淑凤,聂利红. 2020
[8]高粱耐冷基因全基因组鉴定及进化分析. 张国琴,葛玉彬,张正英. 2020
[9]梨CDPK基因家族全基因组序列鉴定分析. 许园园,李晓刚,李慧,蔺经,常有宏. 2015
[10]菠萝SPL基因家族全基因组鉴定及其在开花诱导中的表达分析. 潘晓璐,张秀梅,许婷婷,侯世贵,张红娜. 2020
[11]谷子GRAS转录因子家族的全基因组鉴定、表达分析及标记开发. 王智兰,韩康妮,杜晓芬,李禹欣,连世超,王军. 2022
[12]砀山酥梨TCP基因家族全基因组鉴定与分析. 冀志蕊,董庆龙,谷彦冰,吴建圆,迟福梅,徐成楠,张俊祥,乔壮,周宗山. 2017
[13]阳桃R2R3-MYB家族成员鉴定及其在木质素合成过程中的表达. 赵亚梅,陈蕾,吴春梅,秦思,翟俊文,任惠,吴沙沙. 2021
[14]杧果DBB基因鉴定及其在胶孢炭疽菌和细菌性黑斑病菌侵染过程中的表达分析. 孙宇,刘志鑫,叶子,高爱平,罗睿雄,蒲金基,张贺. 2021
[15]杧果Whirly基因鉴定及其在病菌侵染过程中的表达分析. 孙宇,刘志鑫,叶子,罗睿雄,蒲金基,张贺. 2021
[16]大豆NF-YB家族全基因组鉴定、分类和表达. 郑炜君,徐兆师,冯志娟,李连城,陈明,柴守诚,马有志. 2012
[17]柑橘属SAUR基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 王福生,余洪,胡洲,管德龙,张盼,朱世平,赵晓春. 2020
[18]全基因组水平白花草木樨TCP基因家族的鉴定及在干旱胁迫下表达模式分析. 李艳鹏,魏娜,翟庆妍,李杭,张吉宇,刘文献. 2023
[19]茉莉花TCP基因家族全基因组鉴定及其表达分析. 齐香玉,李新茹,陈双双,冯景,陈慧杰,金玉妍,苗艳华,邓衍明. 2024
[20]辣椒14-3-3蛋白基因家族全基因组鉴定与表达特征分析. 桑婷,颜秀娟,裴红霞,高晶霞,王学梅. 2021
作者其他论文 更多>>
-
5个黍子育成品种耐盐性鉴定
作者:郭娟;王昕;曹晓宁;陈凌;Santra Dipak K;王瑞云;乔治军
关键词:黍子;育成品种;耐盐性;农艺性状
-
我国谷子登记品种遗传多样性分析及综合评价
作者:袁迪;智慧;王海岗;张慧;姚琦;梁红凯;王君杰;陈凌;刁现民;贾冠清
关键词:谷子;登记品种;农艺性状;遗传多样性;综合评价
-
不同肥料配比对糜子产量和品质的调控效应
作者:王君杰;陈凌;田翔;乔治军
关键词:糜子;产量;营养品质;食味品质;施肥方式
-
纳米二氧化硅在植物病虫害防治中的应用
作者:李斐;陈伟;孙嘉振;闵勇;饶犇;朱镭;邱一敏;陈凌;田宇曦;刘晓艳
关键词:植物病虫害;化学农药;纳米二氧化硅;化学合成农药;现有农药;农业生产效率;农药剂型;有效利用率
-
77份山西黍稷DNA二维码身份证的构建
作者:曹越;曹晓宁;陈凌;Santra Dipak K;乔治军;王瑞云
关键词:SSR;黍稷;二维码;山西
-
谷子四大名米品种群农艺及品质性状评价与亲缘关系分析
作者:薛亚鹏;王蓉;柴小娇;王若楠;王倩;刘少雄;王瑞云;刘敏轩
关键词:谷子传统名米;农艺性状;营养品质;相关性分析;亲缘关系
-
基于荧光SSR构建中国糜子核心种质DNA分子身份证
作者:薛亚鹏;丁艺冰;王宇卓;王晓丹;曹晓宁;Santra Dipak K;陈凌;乔治军;王瑞云
关键词:糜子;毛细管电泳;荧光SSR;DNA分子身份证