糜子SBP基因家族全基因组鉴定及表达分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 段政勇

作者: 段政勇;丁敏;王宇卓;丁艺冰;陈凌;王瑞云;乔治军

作者机构:

关键词: 糜子;SBP基因;全基因组鉴定;基因表达分析

期刊名称: 植物学报

ISSN: 1674-3466

年卷期: 2024 年 002 期

页码: 231-244

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: SBP(squamosapromoterbindingprotein)家族广泛参与植物生长发育、信号转导及多种生理生化过程。从糜子(Panicum miliaceum)全基因组中筛选并鉴定到25个SBP基因。系统发育分析表明, PmSBP家族成员分为6个亚家族。同一亚家族成员具有相似的基因结构和保守基序。共线性分析表明,PmSBP与拟南芥(Arabidopsisthaliana)AtSBP和水稻(Oryzasativa)OsSBP分别形成7对和31对直系同源基因。顺式作用元件分析表明,PmSBP启动子区富含逆境胁迫、光反应及激素信号响应元件。基因表达模式分析表明, PmSBP基因表达具有明显的组织特异性、品种特异性及发育阶段特异性,表明SBP基因在糜子生长发育中发挥重要作用。研究结果为揭示SBP基因在糜子生长发育中的生物学功能奠定了基础,也为其它作物SBP基因研究提供了借鉴参考。

分类号: S516%Q943.2

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