宽皮柑橘单核苷酸多态性的高分辨率熔解曲线分型

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴波

作者： 吴波;杨润婷;朱世平;钟云;姜波;曾继吾;钟广炎

作者机构：

关键词： 宽皮柑橘;高分辨率熔解曲线;单核苷酸多态性;基因分型

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2012 年 39 卷 04 期

页码： 777-782

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 高分辨率熔解曲线分析(High resolution melting analysis,HRM)可以检测单碱基改变引起的DNA双链熔解温度(Tm)值变化,从而可以对样本在单核苷酸多态性分子标记(Single nucleotide polymor-phism,SNP)上进行基因分型。通过分析NCBI数据库中宽皮柑橘的表达序列标签(Expressed sequence tag,EST)数据鉴别SNP位点,并用小片段扩增法高分辨率熔解曲线分型技术(High resolution melting analysis of small amplicons)分析11个宽皮柑橘(Citrus reticulata)品种以及柳橙(Citrus sinensis Osbeck var.‘Liucheng’)的5个SNP位点的基因型。结果显示,小片段扩增法高分辨率熔解曲线分型可以快速、清楚地分辨纯合与杂合基因型,在校正温度差异后也可以很好地分辨同一个SNP位点不同的纯合型。统计分析表明样本在所有SNP位点上均存在多态性,5个SNP位点的平均多态性信息含量(PIC)为0.3190,显示样本在这组SNP位点上具有较高的杂合率。

分类号： S666.2

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