二氢黄酮醇还原酶基因在红肉萝卜和白肉萝卜中的序列变异和表达差异

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙玉燕

作者： 孙玉燕;张晓辉;邱杨;李锡香;王海平;沈镝;宋江萍

作者机构：

关键词： ‘心里美’萝卜;二氢黄酮醇还原酶;克隆;序列分析;表达分析

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2014 年 15 卷 03 期

页码： 554-560

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 二氢黄酮醇还原酶是植物花青素合成的关键酶。本研究以中国特有红肉萝卜种质‘心里美’为试材,克隆和分析其二氢黄酮醇还原酶基因(DFR)。通过与大白菜DFR基因的完整CDS序列及白萝卜自交系‘36-2’全基因组序列(未公布)进行比对,获得单一的同源序列Rsa10008592。参照该序列设计5'和3'引物,以‘心里美’萝卜自交系‘HX12Q-49’的cDNA为模板,通过RT-PCR和TA克隆获得ORF为1164 bp(Genbank登录号KF280272)、编码387 aa(Genbank登录号AGU42192)的RsDFR基因的完整CDS序列。通过对白萝卜‘36-2’的Rsa10008592和‘心里美’萝卜‘HX12Q-49’的RsDFR序列比较分析,发现二者之间存在19个核苷酸和3个氨基酸的差异。氨基酸序列进化树显示,‘心里美’萝卜的RsDFR与大白菜和芥菜的DFR同源性较高。荧光定量PCR发现RsDFR在白萝卜和‘心里美’萝卜不同发育阶段的表达模式不同,在白萝卜中仅在肉质根发育的早期表达,而在‘心里美’萝卜的全生育期均有表达,且在破肚期的表达量最高。同时,对‘心里美’萝卜RsDFR基因编码的蛋白质进行了初步分析。

分类号： S631.1

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