口蹄疫病毒株OA/583C蛋白酶的结构模拟和功能分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周建华

作者： 周建华;丛国正;高闪电;常惠芸

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;3C蛋白酶;活性位点

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2007 年 22 卷 06 期

页码： 13-17

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以口蹄疫病毒株OA/58 RNA为模板,反转录并扩增目的cDNA,然后与pGEM-TEasy载体连接并转化JM109菌株,提取的重组质粒用凝胶电泳、PCR和EcoRⅠ酶切法鉴定。该毒株与Poliovirus,Hepatitis Avirus和Human rhi-novirus 89毒株3C序列对比分析发现核苷酸序列一致性分别为38.8%,37.1%和36.5%,氨基酸序列一致性分别为23.7%,19.2%和17.6%。通过Swiss-pdbViewer软件模拟出FMDVOA/58 3C蛋白酶的3D结构和表面模型。并鉴定出此毒株3C蛋白酶的活性中心为Cys31-His46-Asp84。

分类号： S852.65

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