高温胁迫下陆地棉转录组差异性分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王辉
作者: 王辉;董永梅;郭伟锋;曹新川;郭金成;谢宗铭;何良荣
作者机构:
关键词: RNA-Seq;陆地棉;高温胁迫;差异表达;代谢通路
期刊名称: 新疆农业科学
ISSN: 1001-4330
年卷期: 2023 年 60 卷 011 期
页码: 2618-2626
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: [目的]研究陆地棉高温胁迫下关键基因的响应,比较基因表达差异,为揭示陆地棉高温胁迫响应的分子机制提供参考.[方法]利用RNA-Seq对正常温度(26℃)和高温胁迫(42℃)的陆地棉品系YZ1进行转录组测序和数据分析.[结果]在WN4/WH4,WN12/WH12,WN24/WH24,WN48/WH48共鉴定出383个共有上调基因和234个共有下调基因.将差异基因按GO功能分类,主要富集到上调差异基因和下调差异基因20个类别;差异基因显著富集到类黄酮生物合成途径、苯丙烷代谢、昼夜节律-植物、内质网加工等通路;鉴定出39个转录因子,主要是WRKY和MYB两大家族;Gohir.A08G104100是高温胁迫主要的基因,对植物的耐热性至关重要,Gohir.D08G033300是质体类异戊二烯生物合成的限制酶,对叶绿体发育至关重要.2个差异基因在整个时期表达量差异倍数较为显著.[结论]高温胁迫和正常温度下在不同时间段,陆地棉的基因转录表达差异.
分类号: S562
- 相关文献
[1]纳米硒对甜菜叶片转录组的影响. 郑文哲,王莹莹,张辉,张必周,孙梦媛,王良,张惠忠,李晓东,付增娟,赵尚敏,鄂圆圆,张自强. 2024
[2]高温胁迫下不同玉米材料间的基因差异表达分析. 曹丹,张红梅,杨海鹏,赵欢,刘小红. 2021
[3]陆地棉CNGC全基因组鉴定及表达分析. 刘文豪,田琴,余渝,王旭文,马麒,司爱君,孔宪辉. 2021
[4]一株邻苯二甲酸酯降解菌Salipiger sp.D13基因组特征及其降解能力. 刘洋,饶秋华,黄敏敏,罗土炎. 2020
[5]盐胁迫条件下长白10号水稻籽粒中差异代谢物的分析. 张桂云,朱静雯,孙明法,严国红,刘凯,宛柏杰,代金英,朱国永. 2021
[6]种植模式对当归根际细菌群落多样性及代谢通路的影响. 姜小凤,郭凤霞,陈垣,郭建国,刘晓峰. 2021
[7]米蛾嗅觉基因的转录组分析. 李鹏燕,张秋婷,黄铮昱,黄华,陈伟平,廖永林. 2021
[8]发育期间乳鸽血清代谢物及代谢通路的变化. 安勇,计峰,王雪敏,王铮,张帅. 2021
[9]盐胁迫下花生种子萌发期代谢组学分析. 徐扬,丁红,张冠初,郭庆,张智猛,戴良香. 2023
[10]睡莲叶片胎生发育转录组分析. 苏群,田敏,李春牛,李先民,卢家仕,黄展文,李杰梅,卜朝阳,王虹妍. 2021
[11]小菜蛾诱导下的抗虫山芥转录组分析. 魏小春,张晓辉,李锡香,吴青君,沈镝,王海平,邱杨. 2012
[12]健康安格斯犊牛与IBRV感染犊牛鼻腔菌群变化比较. 易鹏飞,孙磊,马亚楠,马雪连,李娜,孙亚伟,钟旗,姚刚. 2024
[13]香水椰子香味物质2-乙酰-1-吡咯啉(2AP)的研究进展. 孙熹微,周丽霞,李静,弓淑芳,杨耀东. 2023
[14]丝状真菌代谢组学研究方法进展. 闫震,陈万权,张昊,刘太国,刘长仲,冯洁. 2021
[15]椰心叶甲、椰子织蛾肠道菌群多样性分析. 李紫成,吕宝乾,卢辉,唐继洪,何杏,苏豪. 2020
[16]两种单色鲤皮肤转录组特征分析. 史东杰,张强,伍仕弘,高坚,魏东,张欣,王赛赛,孙砚胜,姜巨峰,李文通,杨昊坤. 2023
[17]NaHCO3胁迫下马铃薯根系代谢组差异分析. 逯春杏,王晓娇,曹春梅,许飞,张胜. 2024
[18]紫色桑葚和白色桑葚总酚含量、抗氧化能力及代谢指纹图谱差异分析. 刘晴晴,李勇,张明霞,余向阳,杨晨晔,武国华. 2022
[19]NaHCO3生境胁迫下方正银鲫鳃靶器官代谢组学研究. 姚明珠,刘英杰,李姗蔚,陈中祥,王鹏,孙言春. 2022
[20]谷胱甘肽促进牛体外受精胚胎发育的转录组初探. 于学颖,郭芹芹,郝海生,孙尉峻,赵学明,朱化彬,杨凌,杜卫华. 2016
作者其他论文 更多>>
-
7种黄檀属藤本或攀援植物的木材解剖学研究
作者:王露露;刘欣怡;王辉;王军
关键词:黄檀属;藤本植物;攀援植物;木材;解剖学特征
-
60Co-γ辐照对卵清蛋白糖基化体系结构和糖基化产物的影响
作者:卞中悦;涂宗财;王辉;刘光宪
关键词:卵清蛋白;60Co-γ辐照;糖基化体系;结构;糖基化产物
-
葡萄霜霉病流行传播模型和扩散规律研究
作者:于舒怡;李柏宏;刘丽;王辉;关天舒;刘长远
关键词:葡萄霜霉病;空间动态;模拟模型;传播梯度
-
不同茶树品种的祁门红茶适制性研究
作者:雷攀登;黄建琴;刘亚芹;王辉;周汉琛;杨霁虹;黄才旺;李诗涵;徐玉婕
关键词:祁门红茶;茶树品种;适制性;‘凫早2号’;‘皖茶4号’
-
超高压等灭菌方式对刺梨汁营养及风味的影响研究
作者:张欣;王辉;罗婧文;刘嘉;龙明秀;王梅;陈朝军
关键词:刺梨汁;超高压;杀菌技术;营养品质;风味
-
马铃薯晚疫病抗性基因R8分子标记检测与田间抗性评价
作者:娄树宝;杨梦平;邢金月;翟玲侠;王辉;刘春生;王立春;宋继玲
关键词:马铃薯;晚疫病;分子标记;田间抗性
-
不同辣椒品种对细菌性斑点病抗病性鉴定与分析
作者:李柏宏;刘丽;于舒怡;关天舒;邹春蕾;王辉
关键词:辣椒;细菌性斑点病;抗病性鉴定