高温胁迫下陆地棉转录组差异性分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王辉
作者: 王辉;董永梅;郭伟锋;曹新川;郭金成;谢宗铭;何良荣
作者机构:
关键词: RNA-Seq;陆地棉;高温胁迫;差异表达;代谢通路
期刊名称: 新疆农业科学
ISSN: 1001-4330
年卷期: 2023 年 60 卷 011 期
页码: 2618-2626
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: [目的]研究陆地棉高温胁迫下关键基因的响应,比较基因表达差异,为揭示陆地棉高温胁迫响应的分子机制提供参考.[方法]利用RNA-Seq对正常温度(26℃)和高温胁迫(42℃)的陆地棉品系YZ1进行转录组测序和数据分析.[结果]在WN4/WH4,WN12/WH12,WN24/WH24,WN48/WH48共鉴定出383个共有上调基因和234个共有下调基因.将差异基因按GO功能分类,主要富集到上调差异基因和下调差异基因20个类别;差异基因显著富集到类黄酮生物合成途径、苯丙烷代谢、昼夜节律-植物、内质网加工等通路;鉴定出39个转录因子,主要是WRKY和MYB两大家族;Gohir.A08G104100是高温胁迫主要的基因,对植物的耐热性至关重要,Gohir.D08G033300是质体类异戊二烯生物合成的限制酶,对叶绿体发育至关重要.2个差异基因在整个时期表达量差异倍数较为显著.[结论]高温胁迫和正常温度下在不同时间段,陆地棉的基因转录表达差异.
分类号: S562
- 相关文献
[1]纳米硒对甜菜叶片转录组的影响. 郑文哲,王莹莹,张辉,张必周,孙梦媛,王良,张惠忠,李晓东,付增娟,赵尚敏,鄂圆圆,张自强. 2024
[2]高温胁迫下不同玉米材料间的基因差异表达分析. 曹丹,张红梅,杨海鹏,赵欢,刘小红. 2021
[3]陆地棉CNGC全基因组鉴定及表达分析. 刘文豪,田琴,余渝,王旭文,马麒,司爱君,孔宪辉. 2021
[4]一株邻苯二甲酸酯降解菌Salipiger sp.D13基因组特征及其降解能力. 刘洋,饶秋华,黄敏敏,罗土炎. 2020
[5]盐胁迫条件下长白10号水稻籽粒中差异代谢物的分析. 张桂云,朱静雯,孙明法,严国红,刘凯,宛柏杰,代金英,朱国永. 2021
[6]种植模式对当归根际细菌群落多样性及代谢通路的影响. 姜小凤,郭凤霞,陈垣,郭建国,刘晓峰. 2021
[7]米蛾嗅觉基因的转录组分析. 李鹏燕,张秋婷,黄铮昱,黄华,陈伟平,廖永林. 2021
[8]发育期间乳鸽血清代谢物及代谢通路的变化. 安勇,计峰,王雪敏,王铮,张帅. 2021
[9]盐胁迫下花生种子萌发期代谢组学分析. 徐扬,丁红,张冠初,郭庆,张智猛,戴良香. 2023
[10]睡莲叶片胎生发育转录组分析. 苏群,田敏,李春牛,李先民,卢家仕,黄展文,李杰梅,卜朝阳,王虹妍. 2021
[11]小菜蛾诱导下的抗虫山芥转录组分析. 魏小春,张晓辉,李锡香,吴青君,沈镝,王海平,邱杨. 2012
[12]健康安格斯犊牛与IBRV感染犊牛鼻腔菌群变化比较. 易鹏飞,孙磊,马亚楠,马雪连,李娜,孙亚伟,钟旗,姚刚. 2024
[13]香水椰子香味物质2-乙酰-1-吡咯啉(2AP)的研究进展. 孙熹微,周丽霞,李静,弓淑芳,杨耀东. 2023
[14]丝状真菌代谢组学研究方法进展. 闫震,陈万权,张昊,刘太国,刘长仲,冯洁. 2021
[15]椰心叶甲、椰子织蛾肠道菌群多样性分析. 李紫成,吕宝乾,卢辉,唐继洪,何杏,苏豪. 2020
[16]两种单色鲤皮肤转录组特征分析. 史东杰,张强,伍仕弘,高坚,魏东,张欣,王赛赛,孙砚胜,姜巨峰,李文通,杨昊坤. 2023
[17]NaHCO3胁迫下马铃薯根系代谢组差异分析. 逯春杏,王晓娇,曹春梅,许飞,张胜. 2024
[18]紫色桑葚和白色桑葚总酚含量、抗氧化能力及代谢指纹图谱差异分析. 刘晴晴,李勇,张明霞,余向阳,杨晨晔,武国华. 2022
[19]NaHCO3生境胁迫下方正银鲫鳃靶器官代谢组学研究. 姚明珠,刘英杰,李姗蔚,陈中祥,王鹏,孙言春. 2022
[20]谷胱甘肽促进牛体外受精胚胎发育的转录组初探. 于学颖,郭芹芹,郝海生,孙尉峻,赵学明,朱化彬,杨凌,杜卫华. 2016
作者其他论文 更多>>
-
刺梨发酵优势菌种分离鉴定及其营养品质分析
作者:罗婧文;龙明秀;王辉;张芳;王梅;陈中爱
关键词:刺梨;发酵;优势菌种;分离;鉴定;营养品质
-
陆地棉种质资源黄萎病发病率的关联分析
作者:周小凤;曹阳;何良荣;董承光;王新;李娟;林忠旭;余渝
关键词:陆地棉;种质资源;黄萎病发病率;关联分析
-
轮作对香草兰病原菌及根际土壤微生物群落的影响
作者:邢诒彰;洪珊;杨劲明;赵青云;苏凡;庄辉发;王辉
关键词:轮作;香草兰;斑兰叶;根际微生物;微生物群落
-
茶树品种对祁门红茶挥发性代谢谱及关键呈香物质的影响
作者:刘亚芹;王辉;朱林;雷攀登;周汉琛
关键词:品种;祁门红茶;关键挥发性成分;代谢谱
-
基于电子鼻及HS-SPME-GC-MS分析乳酸菌发酵不同碳源刺梨汁风味特征
作者:王辉;罗婧文;龙明秀;王梅;陈中爱;陈朝军
关键词:乳酸菌;刺梨汁;碳源;电子鼻;气相色谱-质谱法;风味
-
玉米耐低氮杂种优势分析
作者:周恪驰;何长安;纪春学;王辉;张恒
关键词:玉米;杂种优势;遗传变异;低氮耐性
-
健康与连作发病香草兰根系分泌物差异成分筛选及其对尖孢镰刀菌的影响
作者:邢诒彰;王洁;王辉;庄辉发;徐飞;赵青云
关键词:香草兰;根系分泌物;代谢组学;尖孢镰刀菌