棉花叶绿体基因组全序列微卫星分布规律研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘方

作者： 刘方;周忠丽;王星星;王春英;王玉红;王坤波

作者机构：

关键词： 棉花;叶绿体微卫星;分布规律

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2015 年 27 卷 06 期

页码： 570-575

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用已公布的陆地棉(Gossypium hirsutum)叶绿体基因组全序列测序结果,应用生物信息学软件对其叶绿体微卫星的分布规律进行了全面分析。结果发现,陆地棉叶绿体基因组上共有72个微卫星,主要分布于大单拷贝区和小单拷贝区,且以单碱基微卫星为主,占总数的76.4%;二碱基微卫星占总数的20.8%;三碱基微卫星占总数的2.8%。在单碱基微卫星中,又以A/T重复为主,二者共占单碱基微卫星的92.7%。单碱基微卫星的重复次数以10~12次为主,二碱基微卫星的重复次数以5~6次为主。本研究结果为开发棉属植物叶绿体通用引物提供了理论依据。

分类号： S562

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