对萼猕猴桃CDPK基因家族鉴定及非生物胁迫应答分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张永杰
作者: 张永杰;白丹凤;Muhammad Abid;李志;方金豹;钟云鹏
作者机构:
关键词: 对萼猕猴桃;全长转录组;CDPK基因家族;盐胁迫;淹水胁迫
期刊名称: 果树学报
ISSN:
年卷期: 2021 年 010 期
页码: 1653-1667
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】鉴定对萼猕猴桃(Actinidia valvata)CDPK家族基因,并分析其在不同组织的表达模式以及对盐胁迫和淹水胁迫的响应。【方法】基于3代全长转录组测序数据,通过多种生物信息学手段,分析和鉴定对萼猕猴桃CDPK家族基因,利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技术分析这些基因在不同组织中的表达,及在不同非生物胁迫条件下的表达情况。【结果】在对萼猕猴桃基因型KR5的全长转录组测序数据中共鉴定出63个CDPK基因,命名为AvCDPK1~AvCDPK63。系统发育分析将AvCDPK基因蛋白分为4个亚家族,同一亚家族具有相似的结构和基序(motif)。AvCDPK基因存在明显的组织表达特异性。AvCDPK49在盐胁迫和淹水胁迫条件下,均显著诱导表达,Av CDPK30和31在2种胁迫下均显著抑制表达。【结论】在对萼猕猴桃中共鉴定出63个CDPK基因,系统发育树显示Av CDPK基因家族与拟南芥CDPK基因家族在进化上高度保守。不同组织中AvCDPK的表达量存在明显差异,其中Av CDPK49受盐害、淹水诱导显著高表达,表明其可能在猕猴桃的耐盐和耐涝响应过程中发挥着重要作用。
分类号: S663.4
- 相关文献
[1]基于全长转录组的蚕豆WRKY基因家族分析及耐盐胁迫相关候选基因挖掘. 周恩强,周瑶,姚梦楠,王学军,赵娜,缪亚梅,王永强,薛冬,李波,汪凯华,顾春燕,魏利斌. 2024
[2]绒毛状烟草钙依赖蛋白激酶基因家族分析. 张丽,张磊,康乐,王军伟,王鲁,龚达平,刘贯山. 2012
[3]姜荷花全长转录组微卫星特征分析和引物设计. 毛俐慧,刘建新,丁华侨,徐笑寒,田丹青. 2018
[4]姜荷花全长转录组微卫星特征分析和引物设计. 毛俐慧,刘建新,丁华侨,徐笑寒,田丹青. 2018
[5]水分胁迫下枣裂果的全长转录组分析. 魏薇,贾彦丽,吴硕,智福军. 2020
[6]薏苡苗期叶片全长转录组测序、注释及SSR预测. 李文燕,崔百元,刘勤坚. 2020
[7]油莎豆块茎转录组测序分析与油脂合成相关基因的挖掘. 焦兵阳,魏尊苗,弥震,才照玄,闫帆,刘雅婧,李景文,王庆钰,牟忠生,王英. 2024
[8]基于PacBio平台的紫娟茶树全长转录组分析. 夏丽飞,孙云南,宋维希,朱兴正,田易萍,蒋会兵,陈林波. 2020
[9]基于单分子实时测序的油莎豆全长转录组分析. 邹智,赵永国,张丽,孔华,郭运玲,郭安平. 2021
[10]芋全长转录组测序分析及淀粉生物合成相关基因挖掘. 何芳练,刘莉莉,蒋慧萍,韦绍龙,邱祖杨,董伟清. 2022
[11]药食同源植物甘葛藤的全长转录组分析. 梅瑜,李向荣,蔡时可,顾艳,王继华. 2021
[12]药食兼用植物黄蜀葵全长转录组测序及特性分析. 叶广英,王再花,刘海林,李杰. 2023
[13]保护品种云茶1号茶树全长转录组测序分析. 朱兴正,夏丽飞,陈林波,田易萍,宋维希,蒋会兵. 2018
[14]淹水胁迫对水稻玉香油占秧苗生长和生理特性的影响. 孔雷蕾,钟卓君,谢萝雅,赵旭生,林子秋,唐湘如. 2017
[15]淹水胁迫下褪黑素浸种对水稻幼苗生长的影响. 李强,彭彦,吴天昊,张秀丽,董家瑜,毛毕刚,赵炳然. 2019
[16]外源二乙基二硫代氨基甲酸钠对初花期淹水大豆根系氮代谢的影响. 邢兴华,方传文,齐玉军,徐泽俊,王晓军,孙东雷,卞能飞,王幸. 2018
[17]苹果砧木幼苗对根际低氧胁迫的生理响应及耐性分析. 白团辉,马锋旺,李翠英,束怀瑞,韩明玉. 2008
[18]淹水胁迫及胁迫解除对甜瓜幼苗呼吸等生理代谢的影响. 张永平,刁倩楠,张文献,田守波,许爽,范红伟. 2019
[19]淹水胁迫及恢复对不同品种甜瓜幼苗生长及其生理生化指标的影响. 刁倩楠,蒋雪君,顾海峰,陈幼源,张永平,范红伟. 2020
[20]不同淹水梯度对紫穗槐的营养生长和生理响应. 王瑞,梁坤伦,周志宇,郭霞,刘雪云. 2012
作者其他论文 更多>>
-
土壤养分含量对山药叶片黄化的影响
作者:苗明军;李菊;林杨;李志;杨亮;常伟
关键词:山药;叶片黄化;pH;有机质;矿质元素
-
利用CRISPR/Cas9技术创制高番茄红素番茄新材料
作者:杨亮;刘欢;马燕勤;李菊;王海娥;周玉洁;龙海成;苗明军;李志;常伟
关键词:番茄;基因编辑;番茄红素;类胡萝卜素;SlSGR1
-
利用CRISPR/Cas9技术创制黄果番茄新种质
作者:龙海成;马燕勤;周玉洁;常伟;李菊;李志;苗明军;杨亮
关键词:番茄;CRISPR/Cas9;八氢番茄红素合成酶1(PSY1);基因编辑;黄果番茄
-
河南省夏玉米花期高温热害时空分布特征
作者:李志;路浩冉;杨官官;李鸿萍;王群;李潮海;周国涛;卢春光;张永恩
关键词:夏玉米;热害;花期;发生频率;时空分布;河南省
-
环形泰勒虫亚端粒编码可变分泌蛋白家族部分基因的研究进展
作者:李志;刘军龙;张学勇;付永;朵红;郭志宏
关键词:环形泰勒虫;转化;亚端粒编码可变分泌蛋白;相互作用
-
海拔变化对棒菜主要农艺性状及产量的影响
作者:苗明军;李菊;林杨;廖继超;雷晓葵;李志;杨亮;钟建;李跃建;常伟
关键词:棒菜;海拔;农艺性状;产量;回归分析;通径分析
-
软枣猕猴桃"多层垂直栽培"架式搭建和整形要点
作者:陈锦永;程大伟;李兰;顾红;郭西智;李明;方金豹
关键词:软枣猕猴桃;架式;整形