中国大菱鲆虹彩病毒主要衣壳蛋白基因的PCR扩增及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 史成银

作者： 史成银;王印庚;黄倢;王清印

作者机构：

关键词： 大菱鲆;虹彩病毒;主要衣壳蛋白基因;聚合酶链反应;序列分析

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2005 年 12 卷 05 期

页码： 588-593

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 应用同源PCR技术,从被一种球状病毒感染的患病大菱鲆(Scophthalmus maximus)脾脏和肾脏组织中扩增出了一段长度为620 bp的DNA片断。序列测定和Blast分析表明,该DNA片断与鱼类虹彩病毒主要衣壳蛋白(MCP)C末端编码区的DNA序列高度相似,由此证实感染养殖大菱鲆的这种球状病毒为一种鱼类虹彩病毒,暂命名为大菱鲆红体病虹彩病毒(TRBIV)。多序列比对和分析发现,TRBIV MCP C末端的205个氨基酸序列与GenBank中20种虹彩病毒相应序列的相似性分别为99.47%(韩国大菱鲆虹彩病毒)、97%~98%(待指定病毒属的7种病毒),以及50%以下(蛙病毒属、淋巴囊肿病毒属、虹彩病毒属的12种病毒),由此绘制出了包含TRBIV在内的21种虹彩病毒的系统发育树。研究结果表明,感染中国养殖大菱鲆的TRBIV属于虹彩病毒科待指定病毒属,位于该属ISKNV亚群和RSIV亚群之间,是该病毒属的一个新成员。

分类号： S943

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