基于Smart-seq2探究玻璃化冷冻对猪孤雌激活囊胚基因表达的影响

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨柏高

作者： 杨柏高;龙熙;张亮;徐皆欢;戴建军;赵学明;潘红梅

作者机构：

关键词： Smart-seq2;玻璃化冷冻;猪;孤雌激活;囊胚

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2024 年 55 卷 009 期

页码： 3936-3946

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在探究玻璃化冷冻对猪孤雌激活(parthenogenetic activation, PA)囊胚基因表达的影响。本研究以猪PA囊胚为研究对象，根据试验处理分为新鲜组、玻璃化冷冻组Ⅰ和玻璃化冷冻组Ⅱ,随后从每组挑选3枚形态良好的囊胚，利用Smart-seq2单细胞全长转录组测序技术进行转录组测序分析。结果显示，玻璃化冷冻组Ⅰ与新鲜组相比，共鉴定到772个差异表达基因(differential expression genes, DEGs),GO和KEGG富集分析结果显示，这些DEGs与细胞脂质代谢过程、细胞葡萄糖稳态、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路等相关；玻璃化冷冻组Ⅱ与新鲜组相比，共鉴定到1 613个DEGs,主要与糖异生、代谢途径、氨基酸生物合成等相关；玻璃化冷冻组Ⅱ与玻璃化冷冻组Ⅰ相比，鉴定到822个DEGs,主要与丙酮酸代谢过程、N-聚糖生物合成、细胞衰老等相关。综上，本研究基于Smart-seq2单细胞全长转录组测序技术揭示了玻璃化冷冻对猪PA囊胚脂质代谢、能量代谢、MAPK信号通路等相关基因表达的影响。

分类号： S828

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