基于转录组测序数据的青稞WRKY基因家族的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 蒋礼玲

作者： 蒋礼玲;陈丽华;尼玛扎西;马晓岗;黄胜雄;李高原

作者机构：

关键词： WRKY;青稞;转录组;系统进化;蛋白互作网络

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2021 年 002 期

页码： 370-379

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： WRKY是植物中一类重要的转录因子,广泛调控了植物的生长发育和逆境胁迫应答。基于青稞白粉病侵染幼苗的转录组测序数据,本研究鉴定得到41个青稞WRKY转录因子,被划分为3个大组:Ⅰ组（6个）、Ⅱ组（21个）和Ⅲ组（12个）。另外,Hv WRKY40和Hv WRKY41没有分组。青稞WRKY基因进化分析的聚类结果和分组结果一致,进一步支持了我们分组的正确性。包括HvWRKY2、HvWRKY8、HvWRKY13、HvWRKY34和HvWRKY41,以及HvWRKY4、HvWRKY7、HvWRKY20、HvWRKY26和HvWRKY30在内的两组WRKY基因,表现出明显的先升高（36 h和72 h）,后降低（168 h）的基因表达趋势。这些WRKY基因很可能参与了调控青稞抗白粉病的分子应答机制。青稞WRKY家族的蛋白相互作用网络中,Hv WRKY3、Hv WRKY8、Hv WRKY9属于网络中的主要中心节点。此外,Hv WRKY3、Hv WRKY8、Hv WRKY9、Hv WRKY30、HvWRKY34、Hv WRKY38、Hv WRKY39彼此之间相互作用,是蛋白互作网络的核心网络。本研究挖掘了青稞的WRKY家族成员,系统分析了家族成员的分组、家族成员的WRKY保守域特点、家族成员之间的进化关系、白粉菌侵染下的基因表达水平和家族成员的蛋白互作网络。本研究可为今后青稞的抗逆研究提供优良的候选WRKY基因。

分类号： S512.3

  • 相关文献

[1]蒺藜苜蓿全基因组中WRKY转录因子的鉴定与分析. 宋辉,南志标. 2014

[2]基于转录组百合WRKY转录因子的挖掘与分析. 周俐宏,石慧,李雪艳,王伟东,白一光,胡新颖,杨迎东. 2023

[3]藜芦bHLH转录因子分析鉴定. 寇呈熹,佟金泉,马瑞,孙伟,薛哲勇,麻鹏达. 2022

[4]青稞响应燕麦镰孢菌侵染的转录组分析. 漆永红,李雪萍,曹素芳,李敏权. 2018

[5]盐碱胁迫下青稞全转录组分析. 扎桑,王玉林,原红军,杨春葆,徐齐君. 2021

[6]害虫对Bt杀虫蛋白抗性相关受体蛋白互作网络分析. 王奎,王泽宇,束长龙,张杰. 2021

[7]猪精子发生候选基因PYGO2的分离、表达和亚细胞定位研究. 赵筱,张霞,范俐,杨忠,霍金龙,曾日彬,刘丽仙,霍海龙. 2021

[8]尖孢镰孢菌与番茄互作早期milRNA调控功能研究. 畅引东,贾仡伟,何瑞,张萌,孟广军,李新凤,张作刚,王建明. 2022

[9]基于网络药理学分析消黄散治疗马火热壅盛证作用机制的研究. 白东东,李新圃,杨峰,罗金印,王旭荣,王丹,张亚茹,李宏胜. 2018

[10]WRKY35转录因子的cDNA克隆与植物表达载体的构建. 伍林涛,杜才富,邵明波. 2010

[11]WRKY转录调控因子在植物与病原体互作中的功能. 伍林涛,万谦,韩宏仕,奉斌,康公平,曾章丽. 2014

[12]农作物旱胁迫响应相关转录因子的研究进展. 巩檑,石磊,宋玉霞,陈虞超,甘晓燕,张丽,李苗. 2013

[13]五个WRKY转录因子在水稻叶片生长和抗病反应中的表达研究. 缪刘杨,李莉云,刘钊,刘雨萌. 2013

[14]中间锦鸡儿WRKY蛋白与豆科等植物同源蛋白的比较分析. 万永青,万东莉,柳金华,王瑞刚,李国婧. 2019

[15]甜高粱WRKY转录因子基因的克隆与表达分析. 徐磊,胡小文,姚艳丽,邢淑莲,刘洋. 2017

[16]WRKY转录因子在植物非生物胁迫抗逆育种中的应用. 司爱君,陈红,余渝,孔宪辉,刘丽,王旭文,田琴. 2019

[17]过表达玉米转录因子ZmWRKY101基因提高拟南芥植株的耐盐力. 郭玉敏,张云华,井涛,臧小平. 2020

[18]丝瓜WRKY转录因子基因的分离与褐变分析. 刘建汀,朱海生,温庆放,王彬,张前荣,陈敏氡,林珲,薛珠政. 2017

[19]植物WRKY转录因子家族基因研究进展. 卜华虎,王晓清,任志强,肖建红,张宁,杨慧珍. 2020

[20]桃WRKY基因家族全基因组鉴定和表达分析. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,周宗山,董庆龙. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序