燕麦bHLH基因的进化特征和胁迫应答成员挖掘
文献类型: 中文期刊
第一作者: 谢铃萱
作者: 谢铃萱;蒋礼玲;孙珂嵘;赵仪凤;王明雪;杨雪飞;黄胜雄;贾举庆
作者机构:
关键词: 燕麦;bHLH;进化;非生物胁迫应答;转录组;蛋白互作网络
期刊名称: 应用与环境生物学报
ISSN: 1006-687X
年卷期: 2025 年 31 卷 008 期
页码: 1259-1277
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 燕麦(Avena sativa)是禾本科燕麦属重要粮食作物,其籽粒富含膳食纤维和β-葡聚糖.挖掘优良基因用于培育高品质、强抗逆的燕麦品种,是当今农业领域关注重点. bHLH转录因子在植物生长发育与抗逆方面发挥着重要的调控作用.基于燕麦基因组和转录组数据,运用多组学数据分析流程和分子生物学方法,解析燕麦bHLH基因的进化特征,挖掘响应非生物胁迫的燕麦bHLH成员及其调控的下游基因.在燕麦基因组中鉴定得到457个bHLH基因;系统进化树中bHLH基因聚成3个大组;bHLH蛋白的保守结构域组成和HLH结构域的保守氨基酸位点组成具有明显的组别特异性.串联倍增与全基因组倍增被证明是燕麦bHLH基因数目扩张的主要动力.在燕麦BY685和OA1613品种的发育外麸中,分别有21、34个bHLH基因显示出趋同或趋异的表达趋势.多个非生物胁迫条件下,分别有47、18个bHLH基因的表达对单一、多个胁迫存在显著响应.响应干旱胁迫的差异表达基因编码蛋白的互作网络中,AsbHLH274、AsbHLH437、AsbHLH450为网络关键节点,其通过互作调控下游的转录因子基因、激酶基因、乙烯和生长素信号途径基因响应干旱胁迫.本研究阐明了燕麦bHLH基因的进化特征,挖掘得到了响应干旱胁迫的bHLH家族成员及其调控的下游基因.(图12表1参37)
分类号: S512.6
- 相关文献
[1]基于转录组测序数据的青稞WRKY基因家族的生物信息学分析. 蒋礼玲,陈丽华,尼玛扎西,马晓岗,黄胜雄,李高原. 2021
[2]苦荞b HLH93转录因子响应铝胁迫的功能研究. 刘桐,王志荣,李伟,刘洋,王祥儒,赖弟利,何毓琦,张凯旋,赵振军,周美亮. 2024
[3]甘蓝型油菜转录因子SRS基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 王龙,张永顺,王红艳,肖麓. 2024
[4]硅对干旱胁迫下燕麦根系响应的分子机理. 张杰,尹强,闫志坚,万永青,王育青. 2021
[5]水分胁迫下燕麦萌发期转录组分析. 安江红,王力伟,斯钦巴特尔,赵梦然,刘红葵,赵沛义,何江峰. 2025
[6]小麦TaLTP5参与小麦与条锈菌的非亲和互作反应. 王凤涛,蔺瑞明,陈万权,冯晶,徐世昌. 2015
[7]小麦 TaLTP5参与小麦与条锈菌的非亲和互作反应. 王凤涛,蔺瑞明,陈万权,冯晶,徐世昌. 2015
[8]害虫对Bt杀虫蛋白抗性相关受体蛋白互作网络分析. 王奎,王泽宇,束长龙,张杰. 2021
[9]猪精子发生候选基因PYGO2的分离、表达和亚细胞定位研究. 赵筱,张霞,范俐,杨忠,霍金龙,曾日彬,刘丽仙,霍海龙. 2021
[10]尖孢镰孢菌与番茄互作早期milRNA调控功能研究. 畅引东,贾仡伟,何瑞,张萌,孟广军,李新凤,张作刚,王建明. 2022
[11]基于网络药理学分析消黄散治疗马火热壅盛证作用机制的研究. 白东东,李新圃,杨峰,罗金印,王旭荣,王丹,张亚茹,李宏胜. 2018
[12]基于种子发育转录组的豌豆bZIP基因家族分析及种子发育候选基因的鉴定. 周恩强,缪亚梅,周瑶,姚梦楠,赵娜,王永强,朱宇翔,薛冬,李宗迪,石宇欣,李波,汪凯华,顾春燕,王学军,魏利斌. 2025
[13]bHLH转录因子的研究进展. 王力伟,房永雨,刘红葵,郭保民,王蕴华,孙瑞芬,吉鹏华,何江峰. 2020
[14]大豆GmbHLH041基因的生物信息学分析及对镉胁迫的响应. 刘晓庆,陈华涛,张红梅,袁星星,崔晓艳,陈新. 2018
[15]MBW复合体在植物花青素合成途径中的研究进展. 高国应,伍小方,张大为,周定港,张凯旋,严明理. 2020
[16]一个大豆脱水胁迫响应的bHLH类转录因子的克隆及功能分析. 陈李淼,沙爱华,张婵娟,单志慧,张晓娟,陈水莲,朱晓玲,刘宝红,祁琳. 2013
[17]基于转录组的洋葱bHLH转录因子家族鉴定与生物信息学分析. 陈微,潘美红,惠林冲,李威亚,郇国磊,何林玉,缪美华,陈振泰,杨海峰. 2023
[18]植物bHLH转录因子的结构特点及其生物学功能. 张全琪,朱家红,倪燕妹,张治礼. 2011
[19]玉米转录因子ABP7响应植物激素的表达分析. 宋丹丹,王银晓,温洪涛,赵军. 2019
[20]植物bHLH转录因子研究进展. 刘文文,李文学. 2013
作者其他论文 更多>>
-
大颖草和短芒披碱草的染色体FISH分析
作者:刘瑞娟;陈文杰;蒋礼玲
关键词:禾草;转座子探针;串联重复探针;异源六倍体;基因组原位杂交;亚基因组;沙生植物
-
赞皇县酸枣产业发展问题及建议
作者:李雪洁;贾东升;崔施展;王明雪;谢晓亮;赵敏;温春秀
关键词:赞皇县;酸枣产业;发展
-
青海高原农作物种质资源保护利用现状与发展趋势分析
作者:金萍;蒋礼玲;侯万伟;黄苗苗
关键词:青海高原;农作物种质资源;保护利用;发展分析
-
连翘叶总黄酮对斑马鱼溃疡性结肠炎的作用研究
作者:吕允珂;郑萱;张菊;崔施展;王明雪;周春伶;贾东升
关键词:连翘叶;总黄酮;斑马鱼;溃疡性结肠炎
-
海东市平安区土壤与农作物Se含量分布特征
作者:苏宁;谢惠春;乔枫;蒋礼玲;祁得胜;王路昊;耿贵工
关键词:平安区;土壤;农作物;硒;分布特征;富集系数
-
紫苏叶醇提物作为抗生素替代物的可行性分析
作者:崔施展;贾东升;孙浩政;王明雪;温春秀;赵敏
关键词:紫苏叶;抗生素替代;炎性肠病;UPLC-MS;免疫
-
桑叶黄酮酶解产物对利血平诱导斑马鱼抑郁的改善作用
作者:郑萱;吕允珂;周春伶;张菊;王明雪;崔施展;贾东升
关键词:桑叶黄酮;酶解产物;斑马鱼;代谢组学;抑郁
