河北省石家庄市番茄黄化曲叶病毒及其伴随DNAβ的分子鉴定及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 韩旭良

作者： 韩旭良;康忱;田哲娟;王鹏;李亚栋;赵雪芳;闫洪波;刘美霞;吴志明

作者机构：

关键词： 番茄黄化曲叶病毒;DNAβ;分子鉴定;序列分析

期刊名称： 河北农业科学

ISSN： 1008-1631

年卷期： 2023 年 002 期

页码： 74-82

摘要： 在河北石家庄市的番茄上分离得到番茄黄化曲叶病毒（tomato yellow leaf curl virus,TYLCV）及其伴随卫星DNA （Betasatellite DNA，又称DNAβ），对其进行分子鉴定及序列分析，明确TYLCV石家庄分离物及其伴随DNAβ分子结构特征及其进化起源。根据已报道的TYLCV及其伴随DNAβ序列设计引物，分别扩增TYLCV石家庄分离物及其伴随DNAβ的全长序列并测序。在NCBI上选取国内外有代表性的TYLCV序列和DNAβ序列，使用MEGA 6.0软件和DNAMAN软件对石家庄TYLCV分离物及其伴随DNAβ进行遗传变异分析。结果表明：TYLCV石家庄分离物全长为2 781 bp，共有6个ORFs，将该分离物定名为TYLCV-SJZ2021。基因组序列比对发现，TYLCV-SJZ2021与山东省的分离物同源性最高（99%）；与2015年本实验室报道的TYLCV石家庄分离物相似度为98.67%，存在37处碱基差异，均属于TYLCV以色列株系。TYLCV-SJZ2021的伴随DNAβ全长1 343 bp，其上有病毒在细胞间移动相关蛋白的BC1编码区，序列比对发现该DNAβ与河南TYLCV伴随DNAβ分子最为相似（98%）。从分子水平上鉴定了TYLCV-SJZ2021及其伴随DNAβ的分类地位，为防治该病毒病害及其抗病育种奠定了基础。

分类号： S432.41

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