大戟科Lhcb基因家族的全基因组鉴定、分类与进化分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 邹智

作者: 邹智;安锋;杨礼富;王真辉;袁坤

作者机构:

关键词: 大戟科植物;全基因组;Lhcb基因家族;鉴定;分类;进化分析

期刊名称: 中南林业科技大学学报

ISSN: 1673-923X

年卷期: 2013 年 33 卷 12 期

页码: 46-52

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 基于已公布的基因组和EST数据,研究对蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树4种大戟科植物的Lhcb基因家族进行系统鉴定,并在此基础上分析其基因结构与进化关系。结果表明,蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树分别含有10、10、13和15个Lhcb基因,分属于Lhcb1、Lhcb2、Lhcb3、Lhcb4、Lhcb5、Lhcb6、Lhcb7和Lhcb8等8个亚家族,每个亚家族包含1~4个成员不等,基因的内含子数目在0~5个之间,部分基因还存在可变剪接形式。进化分析显示,Lhcb1、Lhcb4、Lhcb5和Lhcb7亚族早于单细胞的藻类中就已产生,Lhcb3和Lhcb6亚族在光合生物向陆地进化后产生,Lhcb2亚族存在于高等植物中,Lhcb8亚族则为双子叶植物所特有;Lhcb1亚族在所分析的4种大戟科植物中均出现了基因扩增,Lhcb2和Lhcb5亚族在木薯和橡胶树中出现了扩增,而Lhcb3和Lhcb6亚族仅在橡胶树中出现了扩增。

分类号: S718.46

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