低温胁迫下水稻孕穗期幼穗的转录组动态分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭震华

作者： 郭震华;蔡丽君;潘国君;王立楠;周雪松;杜晓东;蔡永盛;张希瑞;韩笑;周通;马文东

作者机构：

关键词： 寒地水稻;孕穗期;低温;转录组;植物激素

期刊名称： 种子

ISSN： 1001-4705

年卷期： 2024 年 008 期

页码： 60-68,78

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为深入了解寒地水稻孕穗期耐低温机理，明确低温应答的分子机制，本研究对孕穗期耐冷性强的水稻品种龙粳25(LG25)的幼穗进行低温胁迫转录组动态分析。通过测序，共获得515.26 Mb的Clean Reads,筛选获得6 927个差异表达基因(DEGs)。其中，低温处理2 d时，获得6 784个DEGs;低温处理4 d后，DEGs显著减少，仅获得1 149个。GO富集分析表明，韦恩图各部分的上调和下调基因分别显著富集到33个生物进程GO类别，其中包含基因数最多的类别为单生物代谢过程，低温应答和高温应答在LG25的韦恩图各部分富集最多。KEGG富集分析表明，韦恩图各部分DEGs共富集到32条信号通路，其中植物激素信号转导通路在韦恩图各部分显著富集最多，共包含83个DEGs,分布在脱落酸、生长素、油菜素内酯、细胞分裂素、赤霉素、乙烯、茉莉酸、水杨酸等8个激素通路中，以生长素、脱落酸和水杨酸等激素包含的DEGs较多，分别为26个、17个和15个。

分类号： S511

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