大豆GmCOL1和GmCOL13启动子和基因组基因的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 韩英英

作者： 韩英英;陈福禄;傅永福;张晓玫

作者机构：

关键词： 大豆;Gm COL1;Gm COL13;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2017 年 08 期

页码： 63-72

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以大豆天隆1号为材料提取基因组DNA,分别克隆到长2 631 bp的Gm COL1启动子和2 809 bp的Gm COL13启动子。此外,还克隆到Gm COL1和Gm COL13基因组基因长度分别为3 488 bp和2 798 bp,它们分别编码含348个和366个氨基酸的蛋白质。利用Plant CARE分析Gm COL1和Gm COL13的启动子序列发现,它们均含有以下调控元件:生物钟元件(Circadian)、光响应元件(ACEG-box等)、ABA响应元件(ABRE)、干旱诱导元件(MBS)、低温响应元件(LTR)。Prot Param分析表明,Gm COL1和Gm COL13蛋白质的分子量分别为38.47 k D和40.91 k D,并且都是亲水性蛋白。GOR分析显示,Gm COL1和Gm COL13的二级结构含有Alpha helix,Extended strand和Random coil。在线网站PROSITE的分析说明,Gm COL1和Gm COL13有两个Zinc finger B-box和一个CCT domain(CO,CO-LIKE and TOC1 domain)结构域。

分类号： Q943.2`S565.1

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